39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1637 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1637  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  278  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0253  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1666  hypothetical protein  56.14 
 
 
118 aa  131  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0949  hypothetical protein  47.32 
 
 
119 aa  100  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.996626  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1508  hypothetical protein  43.52 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08980  predicted membrane protein  42.73 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.482637 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1034  hypothetical protein  36.27 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0608505  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  37.4 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  39.67 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1561  hypothetical protein  32.14 
 
 
119 aa  60.5  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3957  protein of unknown function DUF1304  34.58 
 
 
120 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1971  hypothetical protein  33.04 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0443  hypothetical protein  32.43 
 
 
119 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3402  hypothetical protein  34.48 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1841  hypothetical protein  34.48 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0455  hypothetical protein  32.43 
 
 
119 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  37.27 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1160  hypothetical protein  35.45 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  36.97 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1223  hypothetical protein  36.7 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  35.29 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0975  hypothetical protein  36.7 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480438  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  30.56 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1143  hypothetical protein  36.7 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0989  hypothetical protein  36.7 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1059  hypothetical protein  36.7 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  39.19 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  35.45 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  31.93 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  31.93 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0977  hypothetical protein  35.78 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  32.17 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1910  hypothetical protein  32.08 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.724765  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  41.54 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  37.38 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  31.09 
 
 
120 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  31.09 
 
 
120 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  32.77 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  30.48 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>