More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1588 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1588  glycosyltransferase  100 
 
 
347 aa  711    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  57.35 
 
 
342 aa  430  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
389 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0738  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
345 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
325 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
325 aa  126  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3633  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
339 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0967  hypothetical protein  27.12 
 
 
324 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0160  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0388  glycosyltransferase  26.38 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0709  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2440  glycosyltransferase  27.54 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0610  glycosyl transferase, family 1  24.57 
 
 
334 aa  86.3  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.62 
 
 
401 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0649  glycosyltransferase  30.87 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12200  glycosyltransferase  26.7 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0778  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0355299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
820 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.19 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3517  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
380 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  21.4 
 
 
437 aa  67  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.89 
 
 
643 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
819 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  26.61 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
384 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
643 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.51 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 
387 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
448 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
401 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.78 
 
 
385 aa  63.5  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.76 
 
 
378 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.07 
 
 
443 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0847  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
470 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700001 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
383 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  22.35 
 
 
402 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  24.05 
 
 
413 aa  63.5  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
406 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.07 
 
 
643 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 
643 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
402 aa  62.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  26.35 
 
 
376 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.68 
 
 
383 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  26.64 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  22.39 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1228  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000548043 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  26.63 
 
 
443 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  25 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
389 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  26.21 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
388 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 
396 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
850 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 
391 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
417 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 
443 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.35 
 
 
376 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 
443 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  27.43 
 
 
390 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 
495 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 
426 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
381 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 
499 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 
380 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
385 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  20.37 
 
 
800 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 
443 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 
443 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
386 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 
498 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  22.58 
 
 
407 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 
421 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>