41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1550 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1550  acetyltransferase  100 
 
 
173 aa  360  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000469847  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0985  acetyltransferase  53.18 
 
 
172 aa  193  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.188436  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  49.43 
 
 
194 aa  167  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2485  acetyltransferase  41.07 
 
 
170 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1311  acetyltransferase  44 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122305  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1376  acetyltransferase  39.88 
 
 
175 aa  131  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151381  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
170 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
169 aa  104  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1488  acetyltransferase  37.72 
 
 
185 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.68875  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1567  acetyltransferase  38.32 
 
 
182 aa  97.4  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0909  Histone acetyltransferase  36.09 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0938  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000016136  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4884  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
172 aa  92  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0489648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1183  acetyltransferase  32.73 
 
 
170 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000821591  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
177 aa  85.5  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0546  acetyltransferase  31.41 
 
 
176 aa  85.1  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  unclonable  9.485090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1014  acetyltransferase  31.52 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000248844  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1053  hypothetical protein  30.51 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.4766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.561407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000829593  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1497  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  27.65 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15187  normal  0.614512 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0994  acetyltransferase  31.21 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  28.22 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.882533  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1508  GCN5-related N-acetyltransferase  28.22 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06590  acetyltransferase (GNAT) family protein  25.97 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  31.25 
 
 
365 aa  58.9  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  29.63 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  25.86 
 
 
173 aa  54.7  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  29.01 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  29.01 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  21.48 
 
 
177 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  28.39 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1363  acetyltransferase  28.39 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.014486  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1761  acetyltransferase  26.28 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 
520 aa  41.2  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4788  GCN5-related N-acetyltransferase  23.57 
 
 
173 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5108  acetyltransferase, gnat family  22.79 
 
 
173 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>