More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1493 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  100 
 
 
450 aa  922    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  50.22 
 
 
459 aa  451  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  47.22 
 
 
453 aa  438  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  46.53 
 
 
451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  46.09 
 
 
458 aa  399  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  44.79 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  45.09 
 
 
456 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  42.04 
 
 
460 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  42.19 
 
 
458 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  41.96 
 
 
454 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  42.19 
 
 
458 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  42.19 
 
 
458 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  41.74 
 
 
458 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  41.96 
 
 
454 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  41.74 
 
 
458 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  41.96 
 
 
458 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  41.96 
 
 
458 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  41.96 
 
 
458 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  41.52 
 
 
457 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  41.39 
 
 
459 aa  359  6e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  41.37 
 
 
453 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  42.44 
 
 
463 aa  354  1e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  42.38 
 
 
453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  42.38 
 
 
453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  41.23 
 
 
454 aa  342  7e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  39.69 
 
 
468 aa  341  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  39.51 
 
 
460 aa  333  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  40.35 
 
 
455 aa  326  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  40.13 
 
 
455 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
456 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  37.87 
 
 
448 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  40.59 
 
 
468 aa  318  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  37.33 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  37.19 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  38.44 
 
 
467 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  37.64 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  37.98 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  36.89 
 
 
459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  36.89 
 
 
459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  36.89 
 
 
459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  36.89 
 
 
459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  36.89 
 
 
459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  36.89 
 
 
459 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  36.83 
 
 
459 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  36.83 
 
 
459 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  36.22 
 
 
458 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  38.08 
 
 
451 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  37.67 
 
 
496 aa  299  9e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  37.61 
 
 
465 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  36.81 
 
 
439 aa  293  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  35.37 
 
 
451 aa  291  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  35.57 
 
 
458 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  37.19 
 
 
462 aa  289  8e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  36.4 
 
 
457 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  35.11 
 
 
513 aa  279  7e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  33.77 
 
 
460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  41.83 
 
 
554 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  34.86 
 
 
461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  34.86 
 
 
461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  32.37 
 
 
470 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.26 
 
 
460 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.41 
 
 
455 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  32.51 
 
 
457 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.23 
 
 
493 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf754  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  35.57 
 
 
449 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  32.67 
 
 
455 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  35.18 
 
 
436 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  41.8 
 
 
438 aa  257  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  33.18 
 
 
495 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  34.36 
 
 
572 aa  257  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  33.48 
 
 
471 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  31.25 
 
 
489 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  32.56 
 
 
479 aa  256  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  34.96 
 
 
485 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  32.96 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.32 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.53 
 
 
401 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  34.6 
 
 
447 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  33.4 
 
 
473 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  33.26 
 
 
466 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  32.89 
 
 
493 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  32.63 
 
 
488 aa  234  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  31.4 
 
 
454 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  31.65 
 
 
452 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  30.43 
 
 
488 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  31.63 
 
 
478 aa  232  9e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  32.79 
 
 
449 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  31.06 
 
 
476 aa  230  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  29.78 
 
 
468 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  29.57 
 
 
482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  31.26 
 
 
456 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  32.69 
 
 
481 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  31.59 
 
 
536 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.03 
 
 
477 aa  219  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.01 
 
 
451 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.01 
 
 
452 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.84 
 
 
469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  30.57 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0053  RNA methyltransferase, TrmA family  33.83 
 
 
415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  32.88 
 
 
419 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>