13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1410 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1410  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  100 
 
 		 256 aa  501  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143094  unclonable  2.44279e-28 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2330  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3260  hypothetical protein  21.96 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0869  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.201874  normal  0.150559 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1336  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0698  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2610  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  23.7 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2274  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0790  hypothetical protein  23.19 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00350  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3025  ABC-2 type transporter  20.12 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.019296 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0291  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.038406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>