More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1389 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  100 
 
 		 160 aa  320  5e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 		 158 aa  190  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 175 aa  190  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  60 
 
 		 175 aa  187  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  58.94 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  58.94 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 160 aa  175  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  58.75 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  60.84 
 
 		 162 aa  174  5e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  52.32 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  52.7 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  52.7 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  51.33 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  46.26 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  48 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  46.25 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  45.1 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  47.37 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  134  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  45.28 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  45.07 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  46.25 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  52.11 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  46.43 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  47.3 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  47.89 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  46.62 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  46.48 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  46.58 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  47.89 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  47.89 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 203 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  47.3 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  44.52 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  48.98 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  47.55 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>