More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1338 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  100 
 
 		 364 aa  727    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  70.64 
 
 		 362 aa  539  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  69.64 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  74.47 
 
 		 385 aa  513  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  67.85 
 
 		 347 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  73.23 
 
 		 343 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  67.85 
 
 		 347 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  70.62 
 
 		 343 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  72.31 
 
 		 343 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  72.31 
 
 		 343 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  70.5 
 
 		 343 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  68.1 
 
 		 355 aa  493  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  73.23 
 
 		 343 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  68.45 
 
 		 349 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  69.39 
 
 		 379 aa  481  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  69.39 
 
 		 379 aa  480  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  63.86 
 
 		 357 aa  478  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  66.56 
 
 		 364 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  66.06 
 
 		 347 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  65.54 
 
 		 341 aa  472  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  67.48 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  63.61 
 
 		 348 aa  464  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  65.45 
 
 		 347 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  64.55 
 
 		 347 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  65.24 
 
 		 345 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  63.83 
 
 		 365 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  65.84 
 
 		 348 aa  461  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  65.53 
 
 		 348 aa  461  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  61.56 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  63.55 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  63.55 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  64.4 
 
 		 346 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  66.46 
 
 		 343 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  67.8 
 
 		 349 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  63.22 
 
 		 358 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  63.44 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  66.15 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  63.03 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  63.91 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  62.01 
 
 		 366 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  63.91 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  62.38 
 
 		 344 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  62.58 
 
 		 346 aa  454  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  60.47 
 
 		 351 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  62.92 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  63.91 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  62.35 
 
 		 350 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  62.8 
 
 		 383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  63.86 
 
 		 343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  61.52 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  63.58 
 
 		 346 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  60 
 
 		 352 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  63.08 
 
 		 367 aa  451  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  61.82 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  63 
 
 		 347 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  59.18 
 
 		 352 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  62.73 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  61.11 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  61.7 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  62.61 
 
 		 345 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  62.73 
 
 		 338 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  60.73 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  62.09 
 
 		 379 aa  448  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  61.85 
 
 		 364 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  60.8 
 
 		 379 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  61.09 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  60.98 
 
 		 350 aa  444  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  63.44 
 
 		 356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  60.24 
 
 		 378 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  63.25 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  62.5 
 
 		 360 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  62.69 
 
 		 358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  63.91 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  62.77 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  63.35 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  60.06 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  60.06 
 
 		 368 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  62.08 
 
 		 344 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  61.3 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  61.4 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  58.46 
 
 		 351 aa  442  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  59.76 
 
 		 361 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  60.86 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  60.73 
 
 		 346 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  61.26 
 
 		 390 aa  441  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  59 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  59 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  63.04 
 
 		 358 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  63.44 
 
 		 336 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  56.66 
 
 		 358 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  61.63 
 
 		 348 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  63.02 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  61.49 
 
 		 348 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  61.3 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  60 
 
 		 349 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  60.24 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  56.94 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  61.16 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  59.76 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  59.94 
 
 		 357 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>