More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1325 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  60.13 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  59.22 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  58.39 
 
 		 304 aa  372  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  58.69 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  55.88 
 
 		 313 aa  362  4e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  53.29 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  54.02 
 
 		 318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  52.73 
 
 		 318 aa  340  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  53.7 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  52.73 
 
 		 318 aa  339  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  53.05 
 
 		 318 aa  338  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  53.05 
 
 		 318 aa  338  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  53.05 
 
 		 318 aa  338  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  53.05 
 
 		 318 aa  338  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  52.73 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  52.73 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  53.05 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  51.63 
 
 		 311 aa  328  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  51.48 
 
 		 310 aa  328  6e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  51.63 
 
 		 311 aa  328  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  48.85 
 
 		 323 aa  288  9e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  45.6 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  46.53 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  45.33 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  44.74 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  46.37 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  46.46 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  42.81 
 
 		 308 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  44.34 
 
 		 309 aa  265  8e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  43.09 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  46.93 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  47.02 
 
 		 306 aa  258  9e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  46.44 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  47.1 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  49.81 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  43.89 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  43.14 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  43.97 
 
 		 348 aa  255  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  43.56 
 
 		 317 aa  254  9e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  44.66 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  43.05 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  44.7 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  44.93 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  44.75 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  41.31 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  42.31 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  42.31 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 409 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  43.96 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  40.73 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  41.37 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.37 
 
 		 427 aa  248  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  43.29 
 
 		 333 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  43.29 
 
 		 333 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  43.29 
 
 		 333 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  46.93 
 
 		 325 aa  248  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  44.53 
 
 		 327 aa  248  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  43.44 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  44.26 
 
 		 326 aa  247  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  41.69 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  43.05 
 
 		 302 aa  245  8e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 346 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  40.65 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  42.4 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  41.31 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  43.18 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  41.98 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  42.28 
 
 		 331 aa  242  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  39.94 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  40.26 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  43.38 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  46.78 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  44.19 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  43.75 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  41.23 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  41.98 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  40.97 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  41.14 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  42.26 
 
 		 314 aa  238  6.999999999999999e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  41.81 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  46.1 
 
 		 316 aa  238  9e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  38.49 
 
 		 547 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  46.1 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  38.31 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  43.85 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  42.49 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  44.91 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  41.44 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  39.74 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  44.7 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  41.35 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>