More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1323 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1323  transcription regulator of beta-galactosidase gene  100 
 
 
333 aa  672    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1087  LacI family transcription regulator  57.31 
 
 
339 aa  391  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.42902  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1949  LacR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
336 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.721622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1063  LacI family transcription regulator  37.98 
 
 
337 aa  196  7e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0539  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 
340 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2079  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 
341 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1547  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 
337 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1340  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 
337 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000460933  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1372  galactose operon repressor  33.33 
 
 
331 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03334  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  31.33 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0302  LacI family transcription regulator  30.63 
 
 
333 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.323775  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1775  LacI family transcription regulator  25.98 
 
 
330 aa  143  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002659  beta-D-galactosidase transcriptional repressor  29.08 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.443693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3369  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  29.71 
 
 
327 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3542  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  29.39 
 
 
327 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02944  DNA-binding transcriptional repressor  29.39 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0626  transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4389  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  29.39 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0625  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  29.39 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02894  hypothetical protein  29.39 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3257  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  29.39 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1972  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  30.45 
 
 
326 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0103522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4137  regulatory protein LacI  29.03 
 
 
359 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0793  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0714  transcriptional regulator, LacI family  28.31 
 
 
334 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0977  transcriptional regulator, LacI family  25.84 
 
 
343 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0741  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0909  LacI family transcription regulator  26.84 
 
 
339 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000295634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  26.44 
 
 
333 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  26.74 
 
 
341 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0881  LacI family transcription regulator  25.07 
 
 
335 aa  99.4  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000659595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0210  LacI family transcription regulator  25.49 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000188149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  24.35 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  28.32 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  22.83 
 
 
348 aa  95.9  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  26.32 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  25.36 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4373  regulatory protein LacI  23.56 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 
336 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1454  LacI family transcription regulator  25.48 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0012728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  25.86 
 
 
351 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.09 
 
 
337 aa  93.2  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0454  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 
339 aa  92.8  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  24.02 
 
 
362 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  26.22 
 
 
344 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0568  LacI family transcription regulator  27.2 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000865309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  25.57 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  24.85 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  24.78 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  24.49 
 
 
342 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  23.97 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  26.45 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  25.5 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  25.37 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  26.78 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  24.78 
 
 
368 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  22.25 
 
 
346 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.35 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  24.29 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  22.29 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  24.43 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3579  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.1 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  22.57 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  24.48 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  24.73 
 
 
349 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5410  LacI family transcription regulator  23.91 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  24.65 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  24.56 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  24.48 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0329  LacI family transcription regulator  21.47 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16025  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  25.43 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  23.93 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.99 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  26.99 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1780  transcriptional regulator, LacI family  23.77 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  22.29 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  23.85 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  24.71 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  24.45 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5012  transcriptional regulator, LacI family  23.55 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0150  transcriptional regulator, LacI family  23.91 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  22.84 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  25.29 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  26.86 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  22.78 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  24.08 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  23.85 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  24.71 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.96 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  22.61 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  24.86 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  25.29 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  24.86 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  25.29 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  24.78 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  25.36 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  23.98 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.72 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>