More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1307 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
403 aa  801    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  67.73 
 
 
405 aa  552  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  66.67 
 
 
404 aa  538  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  65.85 
 
 
399 aa  524  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  64.85 
 
 
396 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  64.85 
 
 
396 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  61.73 
 
 
407 aa  509  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  63.86 
 
 
396 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl577  phosphoglycerate kinase  59.41 
 
 
404 aa  464  1e-129  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0248  phosphoglycerate kinase  59.75 
 
 
398 aa  463  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0631  phosphoglycerate kinase  57.43 
 
 
404 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0347662  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1755  phosphoglycerate kinase  59.61 
 
 
399 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.542191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1766  phosphoglycerate kinase  59.26 
 
 
398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290936  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  58.29 
 
 
399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  58.29 
 
 
399 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  55.61 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  57.07 
 
 
655 aa  441  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  54.9 
 
 
396 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  57.18 
 
 
397 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  56.27 
 
 
394 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  55.17 
 
 
393 aa  428  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  55.67 
 
 
397 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  55.42 
 
 
397 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  56.59 
 
 
402 aa  431  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.99 
 
 
650 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  56.13 
 
 
397 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  54.39 
 
 
400 aa  422  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  55.04 
 
 
394 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  54.55 
 
 
394 aa  418  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  54.55 
 
 
394 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  54.63 
 
 
396 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  54.79 
 
 
394 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  55.04 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  53.32 
 
 
394 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  54.3 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  54.55 
 
 
394 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  54.3 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.92 
 
 
646 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  54.55 
 
 
394 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  54.3 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  55.83 
 
 
398 aa  412  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  53.81 
 
 
394 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  55.06 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  52.93 
 
 
395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  52.96 
 
 
396 aa  403  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  53.55 
 
 
399 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  53.81 
 
 
393 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  51.81 
 
 
403 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  55.28 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  51.6 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  52.83 
 
 
393 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  52.44 
 
 
397 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  52.94 
 
 
395 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  52.43 
 
 
400 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  53.56 
 
 
394 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  52.45 
 
 
395 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf530  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
397 aa  390  1e-107  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0418919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  52.08 
 
 
397 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  52.33 
 
 
395 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  52.07 
 
 
403 aa  385  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  50.97 
 
 
402 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  52.44 
 
 
398 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  51.72 
 
 
396 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 
389 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  51.23 
 
 
396 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  50.61 
 
 
397 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  51.23 
 
 
396 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  51.86 
 
 
396 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  52.21 
 
 
394 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  51.46 
 
 
401 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  51.33 
 
 
402 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  51.12 
 
 
400 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  51.11 
 
 
395 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  50.61 
 
 
402 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  50.85 
 
 
402 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 
392 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  51.12 
 
 
400 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  47.91 
 
 
393 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  49.26 
 
 
395 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  50.61 
 
 
397 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  49.26 
 
 
396 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  50.61 
 
 
397 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 
393 aa  369  1e-101  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 
394 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  52.21 
 
 
397 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 
401 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  49.15 
 
 
402 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  50.73 
 
 
401 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  51.22 
 
 
401 aa  368  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  50.37 
 
 
441 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 
395 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 
394 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  50.25 
 
 
435 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1715  phosphoglycerate kinase  48.46 
 
 
419 aa  365  1e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  50.72 
 
 
406 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  47.16 
 
 
394 aa  363  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  48.14 
 
 
443 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  48.62 
 
 
398 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1252  Phosphoglycerate kinase  48.3 
 
 
400 aa  358  6e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  48.79 
 
 
401 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>