216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1242 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
166 aa  324  3e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  47.74 
 
 
172 aa  152  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  41.29 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  37.2 
 
 
168 aa  112  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  36.08 
 
 
176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  38.71 
 
 
178 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  38.06 
 
 
165 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  34.34 
 
 
168 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  35.37 
 
 
171 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  36.13 
 
 
165 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  97.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  35.37 
 
 
173 aa  97.4  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  35.37 
 
 
173 aa  97.4  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  34.67 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  38.71 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  31.76 
 
 
164 aa  94.4  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  33.54 
 
 
165 aa  84.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  34.19 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  36.36 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  31.37 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  31.03 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  34.23 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  32.16 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  27.39 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.9 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  27.33 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.5 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  25.68 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  33.97 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.48 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  27.03 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  26.88 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  30.72 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  29.53 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  25.93 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.32 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.86 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.26 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  25.71 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.3 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  28.4 
 
 
245 aa  63.9  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2456  F0F1 ATP synthase subunit B  27.94 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  25.64 
 
 
195 aa  62.4  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  29.71 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0018  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000004073  hitchhiker  0.000421111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  27.4 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  27.4 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  31.1 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  31.1 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
171 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00426  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2166  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  29.33 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.99 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  27.44 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>