More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1232 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1232  cell division membrane protein  100 
 
 		 398 aa  798    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000556931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0474  cell cycle protein  54.64 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000113448  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0262  cell division membrane protein  51.5 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0670  cell division membrane protein  54.19 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0972  cell division membrane protein  45.38 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0621  rod shape-determining protein RodA, putative  43.26 
 
 		 401 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.898284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1197  cell division protein  42.49 
 
 		 475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.561695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1691  cell cycle protein FtsW  37.66 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.951767  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2159  cell cycle protein  45.02 
 
 		 400 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2121  cell cycle protein  45.02 
 
 		 400 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0218982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0779  cell cycle protein  36.2 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1634  cell cycle protein  35.75 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4083  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  37.4 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1258  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  37.4 
 
 		 386 aa  215  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0919  cell cycle protein  37.5 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00189274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1325  cell cycle protein FtsW  36.36 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1100  stage V sporulation protein E  37.05 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1363  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  36.36 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1287  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  36.79 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1106  cell division protein ftsW  36.53 
 
 		 386 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1113  cell cycle protein  34.46 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  35.96 
 
 		 365 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4000  cell cycle protein  34.29 
 
 		 392 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00611933  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  37.38 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4064  cell cycle protein FtsW  31.47 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3911  cell cycle protein FtsW  31.22 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4381  cell cycle protein FtsW  31.47 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000586046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4289  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  31.22 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000204689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4231  cell cycle protein FtsW  33.62 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000283909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3902  cell cycle protein FtsW  31.22 
 
 		 392 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  31.82 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4179  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  31.22 
 
 		 392 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00281281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  30.5 
 
 		 380 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  30.96 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  32.72 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  32.53 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4269  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  34.2 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2853  cell cycle protein  32.06 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000185268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  31.71 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0965  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  33.62 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  0.190931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  35.23 
 
 		 367 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  31.41 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  32.65 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  29.37 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  31.09 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  31.03 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  29.72 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  29.95 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  30.08 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08840  cell division membrane protein  36.36 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000221813 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  29.53 
 
 		 407 aa  149  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  31.46 
 
 		 403 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  31.7 
 
 		 408 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  32.93 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  32.41 
 
 		 418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  31.9 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  31.4 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  31.79 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  30.41 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.4 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  30.62 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09500  cell division membrane protein  34.92 
 
 		 606 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0513587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  32.97 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  32.62 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  30.51 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  33.04 
 
 		 367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  33.04 
 
 		 367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  30.71 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  33.1 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  31.18 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  32.66 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  29.63 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  30.68 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  32.64 
 
 		 368 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  33.1 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  28.72 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  36.36 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  31.27 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  31.27 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  32.64 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  32.64 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  32.64 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  31.08 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  30.9 
 
 		 374 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  27.78 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  31.08 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  29.97 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  32.66 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  32.15 
 
 		 371 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  32.26 
 
 		 357 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  34.23 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  32.83 
 
 		 368 aa  142  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  29.49 
 
 		 421 aa  142  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  33.04 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 368 aa  142  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  29.48 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>