More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1170 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1170  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 
591 aa  1206    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.811184  hitchhiker  0.000000000000102391 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0649  beta-lactamase domain-containing protein  50.68 
 
 
593 aa  636    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000403625  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1186  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.1 
 
 
553 aa  599  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1152  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  52.91 
 
 
553 aa  590  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1727  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  50.6 
 
 
570 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0625  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  48.57 
 
 
609 aa  570  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1282  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  47.14 
 
 
636 aa  554  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  42.44 
 
 
583 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 
556 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 
556 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 
556 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  41.49 
 
 
556 aa  477  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  41.49 
 
 
556 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  41.49 
 
 
556 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  41.49 
 
 
556 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  41.49 
 
 
556 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  41.49 
 
 
556 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  41.49 
 
 
556 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1335  beta-lactamase domain-containing protein  41.2 
 
 
574 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.547881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1361  beta-lactamase domain-containing protein  41.2 
 
 
574 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0842  metallo-beta-lactamase family protein  40.65 
 
 
568 aa  468  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  41.74 
 
 
555 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 
556 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.2 
 
 
555 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  41.56 
 
 
555 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  41.61 
 
 
555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  41.61 
 
 
555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  41.61 
 
 
555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  41.61 
 
 
555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.02 
 
 
555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  41.61 
 
 
555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.61 
 
 
555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.61 
 
 
555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  41.24 
 
 
555 aa  445  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.84 
 
 
555 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  39.93 
 
 
555 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.06 
 
 
555 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  38.84 
 
 
555 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  39.2 
 
 
555 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  40.4 
 
 
551 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  38.91 
 
 
553 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  38.56 
 
 
557 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  39.2 
 
 
554 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 
566 aa  425  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 
557 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
557 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  37.32 
 
 
557 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  37.32 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.5 
 
 
557 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  38.48 
 
 
554 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  39.56 
 
 
555 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  36.98 
 
 
560 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.96 
 
 
557 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  39.24 
 
 
555 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  38.36 
 
 
560 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.32 
 
 
557 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  38.11 
 
 
554 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.96 
 
 
557 aa  412  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 
553 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  37.57 
 
 
555 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  37.57 
 
 
554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 
565 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  39.82 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 
565 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  38.48 
 
 
561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 
618 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  37.82 
 
 
560 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
559 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 
555 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1516  beta-lactamase domain-containing protein  36.91 
 
 
618 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  37.68 
 
 
552 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  37.68 
 
 
560 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.27 
 
 
559 aa  381  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 
558 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  35.3 
 
 
560 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 
551 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 
553 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  36.36 
 
 
551 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
551 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  35.39 
 
 
547 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 
558 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
558 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  36.49 
 
 
559 aa  375  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  34.97 
 
 
558 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  33.87 
 
 
561 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  37.41 
 
 
573 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  33.87 
 
 
561 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  35.52 
 
 
593 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 
591 aa  362  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 
548 aa  362  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 
556 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 
569 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 
557 aa  356  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  35.02 
 
 
533 aa  353  5e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 
561 aa  346  8e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  32.54 
 
 
677 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
549 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 
569 aa  336  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
568 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0755  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 
602 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>