More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1167 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  100 
 
 		 449 aa  897    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  61.68 
 
 		 436 aa  523  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  57.31 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  54.82 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  53.5 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  53.88 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  54.55 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  49.88 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  50.35 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  45.52 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  45.33 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  45.33 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  46.71 
 
 		 427 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  46.59 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  45.41 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  45.18 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  45.18 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  45.18 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  45.18 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  45.41 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  45.18 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  45.18 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  45.41 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  44.08 
 
 		 435 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  44.52 
 
 		 446 aa  348  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  42.13 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  41.8 
 
 		 432 aa  332  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  42.49 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  41.16 
 
 		 428 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  40.89 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  40.14 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  41.59 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  39.02 
 
 		 426 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  41.11 
 
 		 451 aa  300  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  38.85 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  37.64 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  35.24 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  36.61 
 
 		 438 aa  282  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  34.75 
 
 		 488 aa  256  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  36.18 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  38.42 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  38.69 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  35.9 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  37.47 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.34 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  33.57 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  34.96 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  34.78 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  34.84 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  33.25 
 
 		 478 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  34.68 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  32.51 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  33.18 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  30.7 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  30.3 
 
 		 435 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  32.68 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  33.9 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  32.05 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  33.41 
 
 		 434 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  33.66 
 
 		 434 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  33.66 
 
 		 434 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  33.41 
 
 		 434 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  33.41 
 
 		 434 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  33.17 
 
 		 434 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  33.41 
 
 		 434 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  30.89 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  30.89 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  34.01 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  30.89 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  32.79 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  31.49 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  32.68 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  32.33 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  33.08 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  32.96 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  31.59 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  31.59 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  31.78 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  31.14 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  31.14 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  31.14 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  31.14 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  31.14 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  31.14 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  31.14 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  31.59 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  31.59 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  31.59 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  31.87 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  31.14 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  30.72 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  31.59 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  31.08 
 
 		 479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  32.54 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  30.3 
 
 		 432 aa  196  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  31.2 
 
 		 471 aa  196  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  30.49 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  30.2 
 
 		 443 aa  196  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  30.57 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>