178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1160 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1160  dithiol-disulfide isomerase  100 
 
 
223 aa  461  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000467454  hitchhiker  3.85744e-21 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 
240 aa  134  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 
236 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  34.13 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  34.9 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
235 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 
237 aa  121  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
234 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 
215 aa  112  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  32.81 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  31.1 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  31.1 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  31.1 
 
 
243 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  30.95 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  30.95 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  34.54 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 
237 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 
223 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  30.62 
 
 
243 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 
211 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  28.02 
 
 
230 aa  104  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 
235 aa  104  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
243 aa  104  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
208 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  31.28 
 
 
223 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 
233 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 
237 aa  101  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
222 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 
213 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 
221 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  26.51 
 
 
215 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 
221 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  30.63 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  30.63 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  29.33 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  26.39 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  27.67 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  26.07 
 
 
244 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  28.17 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  28.1 
 
 
223 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  29 
 
 
203 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  26.07 
 
 
235 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 
221 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  27.75 
 
 
212 aa  92  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  28.44 
 
 
222 aa  91.7  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  29.6 
 
 
224 aa  91.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
244 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  28.23 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 
239 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 
220 aa  89  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  31.43 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  27.51 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  25.46 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 
270 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
221 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  26.27 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  27.27 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  27.62 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  27.15 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>