More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1128 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  100 
 
 
394 aa  807    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  62.44 
 
 
394 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  51.27 
 
 
394 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  47.07 
 
 
395 aa  363  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  45.18 
 
 
397 aa  348  6e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  43.78 
 
 
391 aa  335  1e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  45.34 
 
 
391 aa  334  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  45.77 
 
 
393 aa  334  2e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  44.76 
 
 
400 aa  333  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  42.26 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0333  aminotransferase  42.56 
 
 
404 aa  322  6e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0777  aromatic amino acid aminotransferase  41.94 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  42.89 
 
 
388 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  41.53 
 
 
390 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  39.27 
 
 
391 aa  298  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  40.48 
 
 
396 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  40.48 
 
 
396 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  40.21 
 
 
396 aa  282  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  40.48 
 
 
396 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  40.48 
 
 
396 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  40.48 
 
 
396 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  38.89 
 
 
404 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  40.11 
 
 
396 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  40.48 
 
 
396 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  39.95 
 
 
396 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  39.95 
 
 
396 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  40.21 
 
 
396 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0895  aminotransferase  38.68 
 
 
393 aa  278  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.515472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  40.37 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  39.01 
 
 
393 aa  272  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  38.68 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  37.76 
 
 
399 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  37.17 
 
 
396 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  38.74 
 
 
388 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  38.03 
 
 
390 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  38.38 
 
 
386 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  37.5 
 
 
400 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  38.52 
 
 
385 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.69 
 
 
379 aa  264  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 
407 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  38.06 
 
 
398 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  35.79 
 
 
392 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  35.79 
 
 
392 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 
386 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  35.88 
 
 
387 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  38.34 
 
 
393 aa  256  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  38.04 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  37.43 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  37.76 
 
 
386 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  37.34 
 
 
387 aa  253  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  36.91 
 
 
387 aa  252  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  36.03 
 
 
391 aa  252  7e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  37.6 
 
 
388 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  37.18 
 
 
383 aa  252  9.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  36.29 
 
 
387 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  36.29 
 
 
387 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  38.3 
 
 
393 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  36.29 
 
 
385 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  36.39 
 
 
387 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  35.66 
 
 
385 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  36.13 
 
 
387 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  36.13 
 
 
395 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  35.68 
 
 
398 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  36.03 
 
 
387 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  36.03 
 
 
387 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  35.94 
 
 
398 aa  248  9e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  36.78 
 
 
410 aa  248  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  38.42 
 
 
396 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  35.51 
 
 
391 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0894  aminotransferase  34.99 
 
 
392 aa  247  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.992063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 
401 aa  247  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  36.22 
 
 
387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  36.5 
 
 
385 aa  245  8e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  37.39 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  35.04 
 
 
397 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  35.86 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.33 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  35.64 
 
 
383 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  35.88 
 
 
402 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  37.92 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  36.02 
 
 
395 aa  243  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  38.42 
 
 
393 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
380 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  35.43 
 
 
397 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 
383 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  33.77 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  35.57 
 
 
394 aa  239  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  33.69 
 
 
393 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  36.18 
 
 
401 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  34.81 
 
 
405 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  37.05 
 
 
386 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  36.94 
 
 
387 aa  237  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  35.43 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  37.67 
 
 
379 aa  236  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  35.31 
 
 
381 aa  236  6e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  35.13 
 
 
399 aa  236  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  33.93 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  35.64 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>