More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1118 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 303 aa  614  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  63.76 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  63.76 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  63.42 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  63.76 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  63.76 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  63.42 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  63.76 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  63.3 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  62.75 
 
 		 301 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  62.75 
 
 		 301 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  62.08 
 
 		 301 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  63.21 
 
 		 302 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  62.21 
 
 		 302 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  62.5 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  62.5 
 
 		 299 aa  360  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  58.98 
 
 		 303 aa  357  9.999999999999999e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  57.53 
 
 		 299 aa  352  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  57.53 
 
 		 299 aa  352  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  56.62 
 
 		 302 aa  348  9e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  61.2 
 
 		 301 aa  345  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  56.23 
 
 		 303 aa  345  6e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 		 299 aa  344  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  55.52 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  54.55 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  54.67 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  53.69 
 
 		 300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  53.95 
 
 		 298 aa  318  7e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  53.38 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  51.88 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  52.35 
 
 		 299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  51.72 
 
 		 293 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  53.4 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  51.85 
 
 		 301 aa  302  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  48.8 
 
 		 296 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  53.24 
 
 		 298 aa  299  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  51.68 
 
 		 300 aa  297  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  51.53 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 303 aa  295  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 308 aa  295  9e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 302 aa  291  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  50.67 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  49.48 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  47.99 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  47.65 
 
 		 315 aa  280  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  47.3 
 
 		 297 aa  278  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  48.64 
 
 		 311 aa  275  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  48.66 
 
 		 337 aa  272  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  46.38 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  47.78 
 
 		 324 aa  270  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  48.48 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  47.77 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  47.77 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  47.59 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  46.74 
 
 		 293 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  45.85 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  46.44 
 
 		 306 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  44.26 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  46.51 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  44.12 
 
 		 310 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 		 318 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  46.74 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  45.86 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  46.73 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  45.02 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  46.93 
 
 		 314 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 301 aa  256  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 449 aa  255  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  44.01 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  43.93 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  45.27 
 
 		 468 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  47.87 
 
 		 319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 		 311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  43.61 
 
 		 310 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  43.61 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  45.97 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  45.12 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  43.81 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.792486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>