117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1117 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  34.41 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  30.61 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  31.84 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  30.99 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  29.15 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  29.75 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  29.51 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  25.41 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  26.23 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  26.23 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  26.23 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  26.23 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  26.23 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  26.23 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  26.23 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  25.41 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  25.71 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  23.08 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  25.62 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  25.62 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23.98 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  23.75 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  23.93 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  21.77 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  24.26 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  22 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  23.67 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  23.29 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  20.41 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  23.03 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  22.31 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  21.14 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  21.31 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  22.41 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  23.83 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  24 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  21.37 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  26.02 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  24.15 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  22.96 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  26.27 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  29.83 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  27.03 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  22.71 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  24.86 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  25.93 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  23.49 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  21.31 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  22.17 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  20.73 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  24.35 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  23.81 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  25.41 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  22.27 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  22.76 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  24.74 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0173  DNA repair protein RecO  30.95 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000014605  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  20.16 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  19.84 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  25.86 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  25.68 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  23.86 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  23.16 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  20.33 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  20.33 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  20.33 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  20.33 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  20.33 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  21.72 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  25.56 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  25.56 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  17.6 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  22.03 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  22.08 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  21.7 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  21.02 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  24.16 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  26.04 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  20.45 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  24 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  21.61 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  21.67 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  20.9 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  21.61 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0394  putative recombination protein O  36.49 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.023387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  20.65 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  23.12 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04181  putative recombination protein O  37.08 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.749195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  22.95 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  23.23 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04491  putative recombination protein O  45.83 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.741842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  21.52 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  21.71 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>