More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1067 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  100 
 
 		 765 aa  1563    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  48.54 
 
 		 752 aa  620  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  38.06 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.69 
 
 		 529 aa  266  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  36.26 
 
 		 529 aa  265  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  36.14 
 
 		 529 aa  263  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  35.73 
 
 		 529 aa  263  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  36.07 
 
 		 529 aa  263  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  35.48 
 
 		 529 aa  262  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  35.29 
 
 		 529 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  35.29 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  35.29 
 
 		 529 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  35.29 
 
 		 529 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  35.29 
 
 		 529 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  35.96 
 
 		 529 aa  261  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  35.29 
 
 		 529 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  35.48 
 
 		 529 aa  260  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.11 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  35.21 
 
 		 529 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  35.39 
 
 		 529 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  35.39 
 
 		 529 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  35.39 
 
 		 529 aa  255  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  35.39 
 
 		 529 aa  255  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.08 
 
 		 530 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.52 
 
 		 722 aa  240  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  30.84 
 
 		 556 aa  224  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.17 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.89 
 
 		 578 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  31.44 
 
 		 578 aa  190  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.64 
 
 		 560 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  30.91 
 
 		 580 aa  187  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  29.07 
 
 		 558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  30.09 
 
 		 560 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.8 
 
 		 561 aa  184  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.12 
 
 		 588 aa  183  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  29.05 
 
 		 575 aa  183  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  28.06 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.06 
 
 		 567 aa  177  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  27.19 
 
 		 602 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  28.4 
 
 		 555 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.99 
 
 		 557 aa  173  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  27.77 
 
 		 580 aa  173  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  27.66 
 
 		 575 aa  173  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  27.17 
 
 		 559 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  24.65 
 
 		 571 aa  171  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.09 
 
 		 567 aa  170  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  27.55 
 
 		 560 aa  170  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  28.55 
 
 		 581 aa  168  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  27.89 
 
 		 597 aa  168  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  27.82 
 
 		 585 aa  167  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  28.75 
 
 		 655 aa  165  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  30.9 
 
 		 580 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.35 
 
 		 571 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  28.99 
 
 		 569 aa  163  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  27.26 
 
 		 607 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  29.6 
 
 		 611 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.63 
 
 		 604 aa  150  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  27.53 
 
 		 1577 aa  144  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.38 
 
 		 1215 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.57 
 
 		 1202 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.97 
 
 		 1284 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  27.12 
 
 		 504 aa  134  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  24.51 
 
 		 1311 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.9 
 
 		 1181 aa  129  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.9 
 
 		 1175 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  25.42 
 
 		 583 aa  128  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.04 
 
 		 508 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.55 
 
 		 530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  25.67 
 
 		 1591 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  26 
 
 		 1512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.22 
 
 		 731 aa  117  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  26.64 
 
 		 1506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.4 
 
 		 627 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  25.73 
 
 		 532 aa  115  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  26.76 
 
 		 533 aa  114  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  24.86 
 
 		 1577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  25.81 
 
 		 1652 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  26.17 
 
 		 870 aa  112  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  26.06 
 
 		 523 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.99 
 
 		 503 aa  110  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.39 
 
 		 1525 aa  109  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.95 
 
 		 586 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  23.82 
 
 		 583 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.61 
 
 		 523 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  25.13 
 
 		 520 aa  103  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  25.68 
 
 		 523 aa  97.4  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  24.16 
 
 		 526 aa  97.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  24.43 
 
 		 663 aa  94.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.15 
 
 		 657 aa  94  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  24.42 
 
 		 638 aa  92.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.14 
 
 		 578 aa  91.3  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  23.79 
 
 		 659 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0015  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  25.4 
 
 		 540 aa  88.2  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.66 
 
 		 533 aa  88.2  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.52 
 
 		 607 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  22.53 
 
 		 529 aa  87  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  22.13 
 
 		 750 aa  87  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0193  5'-Nucleotidase domain protein  23.18 
 
 		 647 aa  86.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.84 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  25.9 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>