More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1031 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  100 
 
 		 1204 aa  2458    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  34.68 
 
 		 1230 aa  666    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  32.53 
 
 		 1241 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  32.59 
 
 		 1240 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  32.61 
 
 		 1241 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  32.45 
 
 		 1241 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  32.67 
 
 		 1241 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  31.56 
 
 		 1242 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  32.61 
 
 		 1241 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  32.61 
 
 		 1241 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  32.61 
 
 		 1241 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  31.64 
 
 		 1244 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  32.61 
 
 		 1241 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  32.35 
 
 		 1241 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  32.12 
 
 		 1242 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  32.9 
 
 		 1186 aa  579  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.44 
 
 		 1251 aa  572  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  31.85 
 
 		 1248 aa  558  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  32.67 
 
 		 1233 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  30.66 
 
 		 1244 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.86 
 
 		 1230 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  33.4 
 
 		 1392 aa  506  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  31.8 
 
 		 1217 aa  503  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  31.8 
 
 		 1217 aa  503  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  30.12 
 
 		 1270 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  30.25 
 
 		 1377 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  29.66 
 
 		 1271 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  28.85 
 
 		 1282 aa  485  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  29.98 
 
 		 1218 aa  468  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  28.71 
 
 		 1236 aa  459  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  31.12 
 
 		 1392 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.51 
 
 		 1405 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  28.61 
 
 		 1217 aa  422  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  27.47 
 
 		 1121 aa  372  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.03 
 
 		 1203 aa  327  1e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  30.03 
 
 		 1207 aa  320  9e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 		 1240 aa  320  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 		 1080 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  25.16 
 
 		 1226 aa  194  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  23.98 
 
 		 1182 aa  175  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  23.74 
 
 		 1147 aa  167  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  22.87 
 
 		 1123 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1061 aa  158  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 		 1149 aa  157  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  23.5 
 
 		 1124 aa  156  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.24 
 
 		 1168 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.65 
 
 		 1183 aa  148  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  24.36 
 
 		 1165 aa  145  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  22.28 
 
 		 1117 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  23.86 
 
 		 1156 aa  142  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  22.66 
 
 		 1047 aa  140  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 		 805 aa  140  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  24.95 
 
 		 1184 aa  140  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.96 
 
 		 805 aa  140  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.3 
 
 		 1156 aa  139  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  23.03 
 
 		 1110 aa  137  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  23.03 
 
 		 1110 aa  136  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1057 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 1074 aa  133  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.54 
 
 		 796 aa  133  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.14 
 
 		 798 aa  131  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  22.09 
 
 		 1087 aa  130  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03301  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 809 aa  130  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.479147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.26 
 
 		 1106 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1177 aa  129  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  23.68 
 
 		 1054 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  24.06 
 
 		 1089 aa  129  5e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  22.15 
 
 		 1164 aa  128  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.19 
 
 		 794 aa  128  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1160  UvrD/REP helicase  25.76 
 
 		 1064 aa  129  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.737588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 		 1019 aa  128  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.58 
 
 		 1204 aa  127  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  22.99 
 
 		 1251 aa  126  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  24.32 
 
 		 729 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  24.73 
 
 		 845 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  24.65 
 
 		 757 aa  126  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.54 
 
 		 772 aa  126  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  24.58 
 
 		 727 aa  126  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.19 
 
 		 729 aa  125  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  26.95 
 
 		 728 aa  125  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  25.22 
 
 		 728 aa  125  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.62 
 
 		 729 aa  123  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 854 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.98 
 
 		 758 aa  123  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  23.24 
 
 		 833 aa  122  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25591  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 		 802 aa  121  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.16 
 
 		 1198 aa  121  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.16 
 
 		 1198 aa  121  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  22.51 
 
 		 1115 aa  121  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25 
 
 		 1139 aa  120  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.85 
 
 		 732 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  23.95 
 
 		 814 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.68 
 
 		 715 aa  121  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.47 
 
 		 725 aa  120  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  24.11 
 
 		 728 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  23.81 
 
 		 728 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.17 
 
 		 1226 aa  119  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  23.81 
 
 		 728 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.45 
 
 		 730 aa  119  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.56 
 
 		 757 aa  119  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>