More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1025 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 		 791 aa  1628    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  48.87 
 
 		 754 aa  622  1e-177  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0651  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  48.92 
 
 		 730 aa  610  1e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.188168  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  46.22 
 
 		 879 aa  558  1e-157  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0298  penicillin-binding protein 1A  45.72 
 
 		 750 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.376505  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  43.47 
 
 		 912 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0277  penicillin-binding protein 1A  42.99 
 
 		 773 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  37.06 
 
 		 794 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  41.31 
 
 		 836 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  40.44 
 
 		 830 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  40.59 
 
 		 837 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  40.44 
 
 		 832 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  40.86 
 
 		 901 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0542  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  44.15 
 
 		 623 aa  449  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.158296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  39.81 
 
 		 839 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  40.12 
 
 		 837 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  40.09 
 
 		 834 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  39.94 
 
 		 820 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  39.94 
 
 		 846 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  40.09 
 
 		 835 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  40.09 
 
 		 834 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  38.77 
 
 		 865 aa  426  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  39.23 
 
 		 905 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  38.98 
 
 		 897 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  38.98 
 
 		 900 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  38.98 
 
 		 896 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  38.98 
 
 		 897 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  38.98 
 
 		 897 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  38.98 
 
 		 897 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  38.98 
 
 		 897 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  38 
 
 		 914 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  39.45 
 
 		 647 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  36.9 
 
 		 727 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  36.9 
 
 		 727 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1020  penicillin-binding protein 2  36.74 
 
 		 743 aa  360  4e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 765 aa  349  9e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  36.92 
 
 		 880 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.86 
 
 		 761 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.48 
 
 		 727 aa  336  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  35.1 
 
 		 905 aa  335  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 		 828 aa  324  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 		 795 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  32.16 
 
 		 829 aa  319  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  32.91 
 
 		 814 aa  310  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  35.58 
 
 		 709 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  32.91 
 
 		 727 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  33.07 
 
 		 721 aa  287  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.35 
 
 		 806 aa  284  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  31.45 
 
 		 824 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  31.44 
 
 		 820 aa  277  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  31.6 
 
 		 706 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  31.16 
 
 		 830 aa  270  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  32.02 
 
 		 746 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  31.54 
 
 		 705 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 667 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  32.81 
 
 		 679 aa  267  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  31.11 
 
 		 705 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  34.19 
 
 		 680 aa  267  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  34.19 
 
 		 680 aa  266  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  31.23 
 
 		 746 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  34.19 
 
 		 680 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  30.28 
 
 		 646 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  34.02 
 
 		 680 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 680 aa  265  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  33.85 
 
 		 680 aa  264  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  34.02 
 
 		 673 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  34.02 
 
 		 673 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  31.37 
 
 		 705 aa  263  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  31.37 
 
 		 705 aa  263  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  31.21 
 
 		 705 aa  263  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  31.37 
 
 		 705 aa  263  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  31.05 
 
 		 705 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  32.57 
 
 		 679 aa  261  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  30.7 
 
 		 861 aa  259  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  31.66 
 
 		 843 aa  258  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  32.12 
 
 		 773 aa  257  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  31.8 
 
 		 705 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  31.53 
 
 		 705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  32.95 
 
 		 776 aa  254  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0346  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 		 863 aa  254  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  31.56 
 
 		 656 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  28.92 
 
 		 638 aa  252  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  30.77 
 
 		 641 aa  252  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.76 
 
 		 661 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  31.91 
 
 		 683 aa  251  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  30.72 
 
 		 662 aa  250  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  31.77 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.17 
 
 		 687 aa  249  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31.5 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  30.76 
 
 		 744 aa  249  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.64 
 
 		 649 aa  249  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.75 
 
 		 643 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.75 
 
 		 643 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  31.25 
 
 		 667 aa  248  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.35 
 
 		 735 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  30.92 
 
 		 734 aa  247  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.62 
 
 		 743 aa  247  6.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1213  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.06 
 
 		 686 aa  246  9e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  29.85 
 
 		 693 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.13 
 
 		 685 aa  246  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>