More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1015 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
154 aa  303  6e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 
150 aa  128  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  43.8 
 
 
153 aa  107  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 
155 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 
154 aa  100  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 
160 aa  95.5  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 
161 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  32.24 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
145 aa  84  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 
157 aa  84  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  36.24 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  28.93 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  28.93 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 
165 aa  77  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 
168 aa  77  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  27.67 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  34.43 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 
235 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.67 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 
178 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  28.77 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  32.61 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  36.51 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  34.51 
 
 
180 aa  72  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3744  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00517012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3635  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00213979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3652  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1247  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000373462  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3907  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000548028 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4032  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000325041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
178 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  32.21 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3994  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000820029  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>