139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0935 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  100 
 
 
173 aa  360  4e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  21.64 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0950  GCN5-related N-acetyltransferase  22.54 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0348  GCN5-related N-acetyltransferase  22.64 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000810741  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4788  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4884  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0489648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1014  acetyltransferase  24.43 
 
 
170 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000248844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  24.12 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.561407 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0867  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.46 
 
 
144 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1183  acetyltransferase  23.86 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000821591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1550  acetyltransferase  25.86 
 
 
173 aa  54.7  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000469847  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0985  acetyltransferase  25.68 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.188436  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5108  acetyltransferase, gnat family  27.27 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
305 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  24.2 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  21.84 
 
 
194 aa  51.2  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  23.16 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000829593  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1376  acetyltransferase  25.69 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  32.91 
 
 
369 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  36.07 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  24.28 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.78 
 
 
310 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2140  acetyltransferase  24.67 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.140339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0546  acetyltransferase  26.82 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  unclonable  9.485090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.14 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  25.55 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2058  acetyltransferase, GNAT family  25.33 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00654111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  33.33 
 
 
373 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  24.82 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3250  acetyltransferase, GNAT family  25.33 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000015157  normal  0.297899 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1497  GCN5-related N-acetyltransferase  25.99 
 
 
168 aa  48.1  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  35.94 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
178 aa  48.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2168  acetyltransferase, GNAT family  24 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  21.52 
 
 
168 aa  47.8  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1285  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
168 aa  47.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
530 aa  47.8  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
186 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 
520 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  22.81 
 
 
173 aa  47  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
157 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  24.58 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0070  hypothetical protein  33.33 
 
 
494 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  20.69 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15187  normal  0.614512 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  23.93 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  31.25 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  30.51 
 
 
313 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
299 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06590  acetyltransferase (GNAT) family protein  23.96 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3064  putative acetyltransferase  39.29 
 
 
131 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
148 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1918  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0771647  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  37.5 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35760  hypothetical protein  37.5 
 
 
154 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.28006e-16  decreased coverage  1.5308899999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3326  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2590  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3229  acetyltransferase  31.25 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1922  acetyltransferase  22.67 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1884  acetyltransferase  22.67 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.364881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2069  acetyltransferase  22.67 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  24.83 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1363  acetyltransferase  24.83 
 
 
167 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.014486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
364 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1115  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2100  acetyltransferase, GNAT family  22.67 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1874  acetyltransferase  22.67 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.39507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2557  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
168 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566411  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  0.335188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  24.84 
 
 
146 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  24.84 
 
 
146 aa  44.3  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  24.84 
 
 
146 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  24.84 
 
 
146 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3524  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193717  normal  0.0893278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2214  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.24 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.240965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  24.84 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.67 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  23.03 
 
 
177 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1410  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3200  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.358197  normal  0.871545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  24.22 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0846  putative acetyltransferase  27.85 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  24.22 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  27.95 
 
 
363 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.73 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1155  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.82 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3396  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  36.07 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>