240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0925 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  677    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  40.66 
 
 
340 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0848  hypothetical protein  46.76 
 
 
338 aa  245  6e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  40.36 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  39.76 
 
 
352 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  39.46 
 
 
340 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  39.46 
 
 
340 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  39.46 
 
 
352 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  39.16 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  39.16 
 
 
340 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  40.61 
 
 
340 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  40.3 
 
 
352 aa  235  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0650  hypothetical protein  49.21 
 
 
353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.402397 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  37.13 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  37.69 
 
 
341 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  37.46 
 
 
345 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  31.8 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  31.8 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  33.96 
 
 
363 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  33.02 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  33.82 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  34.3 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  32.89 
 
 
359 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  31.6 
 
 
355 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  33.56 
 
 
324 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  33.91 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  33.91 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  33.69 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  29.88 
 
 
331 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  35.09 
 
 
349 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  35.09 
 
 
349 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  35.09 
 
 
349 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  35.09 
 
 
349 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  34.15 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  30.84 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  30.84 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  32.65 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  30.84 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  32.07 
 
 
359 aa  136  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  33.68 
 
 
348 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  34.15 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  34.15 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  34.15 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  34.15 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  34.15 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  34.15 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  34.15 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  34.15 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  35.36 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  32.54 
 
 
348 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  31.85 
 
 
354 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  31.45 
 
 
340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  32.33 
 
 
362 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  32.65 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  32.65 
 
 
355 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0153  hypothetical protein  32.98 
 
 
345 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  30.77 
 
 
338 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  29.87 
 
 
355 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  33.45 
 
 
340 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  29.59 
 
 
335 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  28.97 
 
 
361 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  32.51 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  34.14 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  30.64 
 
 
360 aa  119  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  29.86 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  30.38 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  31.67 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  31.31 
 
 
336 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  30.64 
 
 
348 aa  116  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  29.35 
 
 
365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  29.94 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  29.35 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  29.75 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  30.23 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  29.43 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  27.76 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  31.16 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  26.2 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  34.42 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  31.13 
 
 
342 aa  110  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  29.66 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  32.86 
 
 
331 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  27.37 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  31.68 
 
 
365 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  30 
 
 
346 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  30 
 
 
361 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  30 
 
 
361 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  28.46 
 
 
329 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  29.51 
 
 
362 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  32.32 
 
 
360 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  32.32 
 
 
360 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  30.87 
 
 
356 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  30.25 
 
 
343 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  30.87 
 
 
356 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  26.79 
 
 
331 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  30.54 
 
 
356 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  30.2 
 
 
356 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  30.71 
 
 
358 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  31.21 
 
 
420 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>