More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0849 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  54.4 
 
 		 312 aa  336  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  53.29 
 
 		 319 aa  319  5e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  52.79 
 
 		 323 aa  317  1e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  49.34 
 
 		 324 aa  285  7e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  48.53 
 
 		 325 aa  285  9e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  45.13 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  45.16 
 
 		 329 aa  262  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  45.21 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  45.21 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  44.08 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  44.08 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  40.19 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  42.95 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  44.09 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  43.42 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  41.61 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  41.72 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  40.98 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  40.45 
 
 		 316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  39.3 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  43.71 
 
 		 314 aa  234  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  41.29 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  43.05 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  39.16 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  39.48 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  39.48 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  39.16 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  39.16 
 
 		 401 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  39.16 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  39.74 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  39.16 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  39.16 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  40.71 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  39.16 
 
 		 316 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  40.6 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  40 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  39.49 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  39.93 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  38.76 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  39.03 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  39.22 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  40.53 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  36.86 
 
 		 316 aa  222  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  40.2 
 
 		 317 aa  222  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  39.87 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  41.21 
 
 		 319 aa  221  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  41.21 
 
 		 319 aa  221  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  39.45 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  39.03 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  37.54 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  36.89 
 
 		 314 aa  211  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  37.34 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  38.05 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  36.33 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  36.79 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  36.18 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  37.93 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  36.39 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  36.42 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  36.92 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  37.86 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  38.19 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  38.19 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  38.19 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  38.19 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  38.19 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  38.19 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  38.19 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  38.19 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  36.09 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  38.19 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  37.54 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  38.19 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  35.83 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  35.2 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  36.16 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  37.42 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.94 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  34.11 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 		 319 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  36.36 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>