More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0844 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  100 
 
 
284 aa  568  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  59.01 
 
 
283 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  60.28 
 
 
300 aa  318  6e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  61.48 
 
 
286 aa  311  6.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  56.64 
 
 
281 aa  292  4e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  53.38 
 
 
286 aa  277  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0362  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  48.58 
 
 
287 aa  268  8.999999999999999e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  52.4 
 
 
327 aa  255  7e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  50 
 
 
280 aa  245  8e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  45.45 
 
 
300 aa  227  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0971  protein of unknown function/lipoprotein, putative  44.28 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1597  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.57 
 
 
282 aa  209  5e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1641  YaeC family protein  47.15 
 
 
274 aa  205  8e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.481009  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  45.34 
 
 
283 aa  202  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  43.8 
 
 
281 aa  202  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  42.8 
 
 
286 aa  199  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  41.91 
 
 
271 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  40.81 
 
 
271 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  40.81 
 
 
271 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  41.18 
 
 
271 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  40.81 
 
 
271 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  40.81 
 
 
271 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  40.81 
 
 
271 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  42.53 
 
 
280 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  42.53 
 
 
280 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  42.74 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.74 
 
 
272 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.74 
 
 
272 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  42.74 
 
 
272 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.74 
 
 
272 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.74 
 
 
272 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.74 
 
 
272 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  38.74 
 
 
323 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.88 
 
 
272 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1798  hypothetical protein  37.13 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1799  hypothetical protein  37.13 
 
 
259 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  42.13 
 
 
284 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  43.7 
 
 
280 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  41.94 
 
 
280 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  41.94 
 
 
280 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  42.45 
 
 
266 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.51 
 
 
284 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  43.13 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  43.13 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.13 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.13 
 
 
284 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  39.69 
 
 
284 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  42.37 
 
 
284 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  41.46 
 
 
286 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  41.22 
 
 
279 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  37.05 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  37.5 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.35 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.5 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.55 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  41.39 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  40 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  36.8 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  38.99 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.99 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.99 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  38.99 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.99 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.99 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.99 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.77 
 
 
271 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.69 
 
 
270 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  38.63 
 
 
271 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.63 
 
 
271 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.63 
 
 
271 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1651  NLPA lipoprotein  38.96 
 
 
291 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.63 
 
 
271 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.63 
 
 
271 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  36.89 
 
 
275 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.63 
 
 
271 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.63 
 
 
271 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.63 
 
 
271 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.41 
 
 
271 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  36.79 
 
 
271 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.41 
 
 
271 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.41 
 
 
271 aa  168  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  40.43 
 
 
268 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  40.6 
 
 
268 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.67 
 
 
271 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.52 
 
 
271 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  39.84 
 
 
270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  34.66 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  38.25 
 
 
270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  41.63 
 
 
269 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  40 
 
 
278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  37.92 
 
 
276 aa  165  9e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1585  NLPA lipoprotein  36.02 
 
 
287 aa  165  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255778  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  39.57 
 
 
268 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0867  NLPA lipoprotein  37.77 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666915  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4336  NLPA lipoprotein  38.26 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0157  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  37.13 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619051  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  40.09 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5086  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  36.9 
 
 
272 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.121383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0044  lipoprotein, YaeC family  37.3 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3873  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  36.9 
 
 
272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>