More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0838 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0838  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 428 aa  875    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000046981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0283  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 		 418 aa  520  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  55.8 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  55.34 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  56.13 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  55.02 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  57 
 
 		 432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  55.72 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  55.9 
 
 		 425 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  53.85 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  53.85 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  55.26 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  55.56 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  53.85 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1786  phosphopyruvate hydratase  53.68 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.897912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  54.99 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  54.5 
 
 		 422 aa  441  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  55.8 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  54.99 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  54.88 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  55.16 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  55.9 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  53.44 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0200  phosphopyruvate hydratase  53.55 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.969162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  53.48 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  55.64 
 
 		 427 aa  431  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  55.29 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  55.29 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  55.29 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  53.86 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0775  phosphopyruvate hydratase  54.05 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.274671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  55.26 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  55.29 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2001  phosphopyruvate hydratase  54.09 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000177738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  54.94 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  55.29 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  53.19 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  55.05 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  54.83 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0662  phosphopyruvate hydratase  54.29 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0321  enolase  55.16 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  54.76 
 
 		 425 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2235  enolase  53.64 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  53.75 
 
 		 426 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  55.29 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  53.38 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  55.9 
 
 		 425 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  54.72 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  53.59 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  55.05 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  52.25 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  54.07 
 
 		 422 aa  428  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0975  phosphopyruvate hydratase  53.27 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0568792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  52.78 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  53.98 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  53.27 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  55.29 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  54.57 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  54.22 
 
 		 425 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2093  phosphopyruvate hydratase  51.07 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.470329  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  54.22 
 
 		 425 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  53.01 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  54.46 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  53.79 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  53.66 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  54.72 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  55.18 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  54.74 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0949  phosphopyruvate hydratase  53.11 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5238  enolase  53.79 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  53.14 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  51.77 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1253  Phosphopyruvate hydratase  54.01 
 
 		 425 aa  420  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2195  enolase  52.8 
 
 		 426 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000497652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1614  enolase  57.28 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  52.01 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  52.4 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  52.78 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  54.31 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  53.08 
 
 		 431 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  53.86 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  54.59 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  54.11 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0615  phosphopyruvate hydratase  53.41 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  51.54 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1850  phosphopyruvate hydratase  53.62 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  51.71 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  53.14 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  51.06 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  53.25 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  51.54 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  53.86 
 
 		 427 aa  418  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  53.51 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  52.14 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  53.96 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1909  enolase  55.08 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  54 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  52.78 
 
 		 423 aa  418  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  51.06 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0339  phosphopyruvate hydratase  54.07 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>