More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0810 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0810  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  346  8e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0615439  hitchhiker  0.00120973 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  48.73 
 
 
157 aa  160  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  46.79 
 
 
157 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  49.36 
 
 
156 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  46.79 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  47.44 
 
 
156 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  46.79 
 
 
157 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1351  hypothetical protein  47.44 
 
 
155 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1325  hypothetical protein  47.44 
 
 
155 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  47.44 
 
 
155 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0379  hypothetical protein  43.59 
 
 
157 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000399241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  41.4 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  43.62 
 
 
152 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0377  hypothetical protein  46.77 
 
 
127 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.467717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  41.94 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  40.76 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0813  hypothetical protein  42.14 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000388693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  43.51 
 
 
151 aa  111  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  37.97 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  40.54 
 
 
155 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  38.61 
 
 
151 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  34.81 
 
 
158 aa  104  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  37.75 
 
 
154 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  37.75 
 
 
156 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  37.82 
 
 
161 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  36.36 
 
 
154 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1359  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  92  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0045809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  36.65 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  34.16 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  34.16 
 
 
160 aa  88.2  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  32.5 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  31.87 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  36.65 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  38.51 
 
 
159 aa  84.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  30.14 
 
 
177 aa  84.3  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  32.5 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  31.9 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  33.83 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  36.08 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  35.34 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2319  protein of unknown function DUF150  40.18 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0432974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  32.67 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  34.59 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0429  hypothetical protein  40.82 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.416623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  32.08 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  32.52 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  33.74 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  32.67 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  33.08 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  33.83 
 
 
204 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  32.69 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  33.08 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  29.2 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  34.65 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  31.41 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  33.08 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  32.28 
 
 
203 aa  73.9  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  31.45 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0773  protein of unknown function DUF150  35 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09340  hypothetical protein  32.8 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000007629  normal  0.602574 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  32.17 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  28.48 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  32.58 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  31.45 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  32.58 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  34.71 
 
 
207 aa  72  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  32.28 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  32.06 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  33.11 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  32.56 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  32.56 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  30.94 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  30.71 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  30.94 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0896  hypothetical protein  31.11 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000785256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  31.3 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  30.94 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  29.11 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  33.59 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  33.82 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  30.94 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  32.56 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  31.3 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  31.13 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  35.61 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  34.17 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  29.73 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>