More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0806 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  50.19 
 
 
261 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  52.04 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  49.06 
 
 
264 aa  243  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  46.99 
 
 
263 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.77 
 
 
264 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  46.74 
 
 
263 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  48.5 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  48.12 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  48.12 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  47.74 
 
 
263 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  48.5 
 
 
263 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  48.5 
 
 
263 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  48.5 
 
 
263 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  48.12 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  47.29 
 
 
255 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  43.19 
 
 
260 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  43.19 
 
 
260 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.8 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  39.47 
 
 
264 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  44.79 
 
 
264 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  39.55 
 
 
267 aa  155  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  33.85 
 
 
262 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  33.08 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  37.16 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  47.1 
 
 
260 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  47.66 
 
 
285 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  52.07 
 
 
270 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  46.97 
 
 
287 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.42 
 
 
264 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 
296 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.42 
 
 
267 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  38.73 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  32.24 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  34.25 
 
 
267 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
294 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.25 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  37.01 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  30.71 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  45.99 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 
267 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  39.77 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  29.48 
 
 
275 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  34.74 
 
 
285 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  29.41 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  32.1 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  31.85 
 
 
282 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  31.85 
 
 
282 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  31.85 
 
 
282 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  30.92 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  40.25 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  49.15 
 
 
233 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1424  phosphatidate cytidylyltransferase  34.35 
 
 
264 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.521758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  43.51 
 
 
285 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 
296 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
211 aa  112  6e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 
280 aa  112  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  41.18 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  46.62 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  46.81 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  32.98 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  32.73 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  40.74 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  37.78 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  36.57 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  40.25 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  40.12 
 
 
285 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 
285 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
284 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.12 
 
 
285 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40.12 
 
 
285 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  40.12 
 
 
285 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
286 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 
273 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  38.83 
 
 
282 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 
285 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40.12 
 
 
285 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  40.12 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  39.38 
 
 
286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  47.73 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  45.14 
 
 
280 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
280 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 
252 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>