More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0797 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
597 aa  1222    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.05 
 
 
604 aa  588  1e-167  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  47.86 
 
 
594 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.03 
 
 
599 aa  569  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  50.69 
 
 
594 aa  555  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  44.54 
 
 
587 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  45.6 
 
 
587 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  45.26 
 
 
587 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 
587 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 
587 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.26 
 
 
587 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  45.25 
 
 
587 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.26 
 
 
587 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.91 
 
 
587 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.74 
 
 
587 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  45.14 
 
 
592 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.9 
 
 
581 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.61 
 
 
579 aa  505  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  44.39 
 
 
587 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  44.35 
 
 
600 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  43.57 
 
 
606 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
594 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  41.11 
 
 
677 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  37.74 
 
 
588 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  37.11 
 
 
586 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.21 
 
 
666 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.02 
 
 
666 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  41.21 
 
 
666 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.05 
 
 
666 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.62 
 
 
666 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.21 
 
 
666 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  41.21 
 
 
666 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  41.03 
 
 
666 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 
622 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  37.18 
 
 
592 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  40.4 
 
 
650 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  40.86 
 
 
666 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  35.25 
 
 
589 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.79 
 
 
600 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.22 
 
 
617 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  35.22 
 
 
614 aa  368  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  36.05 
 
 
597 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.76 
 
 
597 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.67 
 
 
589 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
607 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  36.02 
 
 
613 aa  362  8e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.1 
 
 
614 aa  362  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.1 
 
 
608 aa  361  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  34.51 
 
 
585 aa  360  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.85 
 
 
597 aa  359  6e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.85 
 
 
597 aa  360  6e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  34.9 
 
 
587 aa  358  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  35.25 
 
 
591 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  37.5 
 
 
671 aa  356  5.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  34.66 
 
 
613 aa  356  7.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  34.78 
 
 
611 aa  355  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  34.36 
 
 
619 aa  355  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  33.91 
 
 
611 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.82 
 
 
609 aa  355  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2809  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
685 aa  353  5e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000401282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.26 
 
 
598 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  33.95 
 
 
611 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  35.24 
 
 
603 aa  350  4e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  34.66 
 
 
637 aa  350  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  34.94 
 
 
606 aa  349  7e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  35.58 
 
 
663 aa  349  8e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.6 
 
 
592 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  35.53 
 
 
608 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.91 
 
 
598 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.09 
 
 
598 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  32.05 
 
 
635 aa  347  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.41 
 
 
623 aa  347  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  34.78 
 
 
605 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.99 
 
 
610 aa  347  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.09 
 
 
598 aa  346  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  34.89 
 
 
620 aa  346  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36 
 
 
617 aa  346  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  35.63 
 
 
582 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  36.44 
 
 
588 aa  346  8.999999999999999e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.91 
 
 
598 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  37.6 
 
 
592 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  36.47 
 
 
590 aa  343  5e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  34.61 
 
 
584 aa  343  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  34.53 
 
 
602 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  33.91 
 
 
598 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.91 
 
 
598 aa  343  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.91 
 
 
598 aa  343  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.91 
 
 
598 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  33.56 
 
 
625 aa  342  9e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  33.22 
 
 
640 aa  342  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  33.62 
 
 
631 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.86 
 
 
620 aa  340  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  36.36 
 
 
645 aa  340  5e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  34.21 
 
 
598 aa  340  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.51 
 
 
607 aa  339  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.89 
 
 
702 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  33.79 
 
 
603 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  36.09 
 
 
588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  37.04 
 
 
765 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  34.64 
 
 
634 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>