More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0732 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  603  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000598686  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 339 aa  142  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 310 aa  89  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  28.36 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  23.91 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 686 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 686 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0396  AraC-like transcriptional regulator  24.05 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000261695 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1243  AraC-like transcriptional regulator  25.09 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  22.18 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.01 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2295  AraC family transcriptional regulator  19.37 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  19.83 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 513 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1626  AraC family transcriptional regulator  20.49 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1613  cupin 2 domain-containing protein  26.54 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0246689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  24.86 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2344  AraC family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  decreased coverage  0.000000160682 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 793 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1251  two component transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 566 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  22.27 
 
 		 745 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  22.27 
 
 		 745 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  22.14 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  30.69 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  19.42 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  21.46 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1172  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.324704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 1201 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  22.61 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4950  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  28.43 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  30.39 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6523  transcriptional regulator, AraC family  19.78 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.399934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  26.6 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4283  transcriptional regulator, AraC family  24.64 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2466  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0266  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  27.72 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0027  transcriptional regulator, AraC family  30.58 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  19.22 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  24.65 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4609  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  27.72 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.917171  normal  0.375209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  24.24 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4516  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  27.72 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4660  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  27.72 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>