More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0504 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0504  malolactic fermentation system transcription activator  100 
 
 		 294 aa  603  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1528  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1533  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.289037  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1565  malolactic fermentation system transcription activator  26.22 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  27.34 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0942  malolactic fermentation system transcription activator  26.62 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000616664  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1004  malolactic fermentation system transcription activator  21.96 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1440  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0142  LysR family malolactic regulator  22.98 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000010919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  24.61 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 305 aa  89  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  23.83 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1730  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1696  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  24.33 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1453  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.248466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1621  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.358841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1691  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1543  transcriptional regulator, LysR family  24.81 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2833  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2815  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  27.03 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2958  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1916  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0836  transcriptional regulator, LysR family  24.49 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.192255  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1787  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000671509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2914  LysR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.298049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  22.87 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0047  LysR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0063  LysR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  23.35 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0045  LysR family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3228  LysR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2215  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0036  LysR family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  23.74 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  25.76 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  22.83 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0026  LysR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0044  LysR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  21.26 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2801  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  23.68 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0691  LysR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.780494  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  21.72 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  22.48 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  23.81 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0641  transcriptional regulator, LysR family  25.31 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3760  transcriptional regulator, LysR family  22.95 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1720  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0400  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  27.23 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  22.66 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  24.19 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  23.6 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.1 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  22.69 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.1 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  23.27 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  22.87 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.1 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0176  LysR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>