More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0502 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  100 
 
 		 475 aa  986    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  55.25 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  55.25 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  55.13 
 
 		 470 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  52.15 
 
 		 484 aa  523  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  54.82 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  50.85 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  41.68 
 
 		 446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  39.04 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  38.43 
 
 		 465 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  37.68 
 
 		 458 aa  325  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  39.23 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  38.54 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  38.4 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  37.05 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  36.62 
 
 		 463 aa  312  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  37.92 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  37.71 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  37.39 
 
 		 446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  37.63 
 
 		 446 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  36.08 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  35.5 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  37.68 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  35.91 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  36.33 
 
 		 469 aa  297  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  37.74 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  38.35 
 
 		 438 aa  296  8e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  36.03 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  35.56 
 
 		 448 aa  292  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  36.93 
 
 		 482 aa  292  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  37.39 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  35.88 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  35.1 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  37.76 
 
 		 478 aa  290  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  35.03 
 
 		 478 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  34.6 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  35.83 
 
 		 464 aa  287  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  35.58 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  35.29 
 
 		 465 aa  286  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 		 478 aa  286  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  36.01 
 
 		 467 aa  286  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  37.76 
 
 		 478 aa  286  8e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  33.54 
 
 		 499 aa  286  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  36.67 
 
 		 459 aa  285  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  35.68 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  34.89 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  36.38 
 
 		 478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  35.41 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  34.7 
 
 		 447 aa  283  6.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  34.62 
 
 		 458 aa  282  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  37.01 
 
 		 448 aa  282  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  35.7 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 479 aa  280  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  34.38 
 
 		 472 aa  279  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  36.5 
 
 		 474 aa  279  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  33.61 
 
 		 488 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  35.76 
 
 		 488 aa  276  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  34.3 
 
 		 478 aa  276  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  33.4 
 
 		 448 aa  276  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  35.13 
 
 		 453 aa  276  8e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  34.38 
 
 		 466 aa  275  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  34.16 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  35.96 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  33.54 
 
 		 461 aa  274  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  35.46 
 
 		 463 aa  274  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  35.74 
 
 		 467 aa  274  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  35.77 
 
 		 479 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  35.04 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  35.16 
 
 		 455 aa  272  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  33.61 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  34.33 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  36.32 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  33.55 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  33.48 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  33.06 
 
 		 487 aa  269  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  35.19 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  33.55 
 
 		 468 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  33.76 
 
 		 470 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  34.19 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  32.7 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  32.91 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  33.99 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  32.4 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  36.25 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  34.09 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  32.78 
 
 		 470 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  33.76 
 
 		 451 aa  262  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  32.42 
 
 		 453 aa  262  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  34.04 
 
 		 463 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  34.41 
 
 		 475 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  33.76 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  34.11 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  31.99 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  32.92 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  34.59 
 
 		 475 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  31.99 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  32.99 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  32.51 
 
 		 494 aa  261  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  35.46 
 
 		 466 aa  261  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>