71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0499 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  100 
 
 		 279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  32.49 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  31.91 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  28.99 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  29.24 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  28.88 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  29.14 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  28.78 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  29.14 
 
 		 282 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  29.18 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  28.62 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  29.14 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  29.14 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  29.14 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  29.14 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  29.14 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  29.14 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  30.58 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  28.21 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  29.14 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  28.27 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  28.42 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  25.62 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  28.67 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  28.32 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  28.88 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  26.52 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  28.88 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  26.79 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  26.43 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  26.43 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  26.79 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  26.43 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  26.43 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  27.7 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  25.71 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  25 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  27.08 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  27.24 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  26.26 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  28.06 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  28.72 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  24.01 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  24.2 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  23.66 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  25.18 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  27.14 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  26.33 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  23.3 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  23.38 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  24.21 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  25.62 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  21.63 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  25.63 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  22.92 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  25 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  25 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  25.7 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  24.3 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  23.43 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  21.11 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  24.34 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  28.57 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  24.34 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  21.6 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  26.64 
 
 		 741 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  24.87 
 
 		 692 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.78 
 
 		 977 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.56 
 
 		 646 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  28.29 
 
 		 651 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  28.29 
 
 		 651 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>