More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0481 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0481  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 492 aa  972    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000249474  normal  0.792564 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0482  major facilitator superfamily permease  62.16 
 
 		 497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1525  major facilitator transporter  47.93 
 
 		 519 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0244  major facilitator superfamily permease  32.84 
 
 		 473 aa  263  6e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00531035  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  31.21 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 511 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.66 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.66 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  28.66 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  28.45 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  30.77 
 
 		 513 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.77 
 
 		 513 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  30.77 
 
 		 513 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 513 aa  199  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 513 aa  199  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.24 
 
 		 479 aa  199  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.24 
 
 		 479 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 		 513 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.55 
 
 		 513 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.55 
 
 		 513 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.38 
 
 		 469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.25 
 
 		 513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.25 
 
 		 513 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 511 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 569 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  28.78 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  29.09 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 		 480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.8 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 		 539 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  29.8 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  29.76 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 		 511 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.94 
 
 		 523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 541 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 		 697 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.49 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.56 
 
 		 504 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.41 
 
 		 511 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 538 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.58 
 
 		 538 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 565 aa  177  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.69 
 
 		 535 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.32 
 
 		 678 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 548 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 		 506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.63 
 
 		 621 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 537 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  30.29 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  30.29 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  30.29 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  30.29 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.21 
 
 		 680 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.78 
 
 		 491 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  30.29 
 
 		 476 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 		 501 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  29.69 
 
 		 537 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  29.69 
 
 		 537 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 528 aa  169  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.08 
 
 		 672 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 539 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  30.32 
 
 		 537 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 448 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.25 
 
 		 431 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.48 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.37 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.47 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 		 890 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 505 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.79 
 
 		 554 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.31 
 
 		 531 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  28.76 
 
 		 515 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 		 537 aa  160  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.34 
 
 		 528 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0727  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.2 
 
 		 502 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.28 
 
 		 607 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 538 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.5 
 
 		 650 aa  156  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.55 
 
 		 528 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.54 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.83 
 
 		 522 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.68 
 
 		 567 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.29 
 
 		 666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.09 
 
 		 530 aa  154  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.22 
 
 		 526 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
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NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.23 
 
 		 495 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
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NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.98 
 
 		 524 aa  153  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 489 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 504 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.49 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.49 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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