212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0474 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.44 
 
 		 213 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.57 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.65 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.44 
 
 		 211 aa  168  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.96 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.15 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  35.48 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  33.92 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  33.48 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  33.18 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  32.87 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  32.87 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  30.28 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  31.67 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.73 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  32.24 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  32.03 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  30.59 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  34.55 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  30.45 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  34.42 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.95 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  35.67 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  29.24 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  35.4 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  35.17 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  29.63 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.41 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  28.14 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  33.74 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  30.81 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  25.22 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  32.28 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  27.38 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2462  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.73 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 476 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.73 
 
 		 476 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.73 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00874  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  32.73 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00880  hypothetical protein  32.73 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.73 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 374 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.73 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.42 
 
 		 327 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  30.06 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  22.51 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  25.57 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  25.58 
 
 		 349 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  25.11 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 325 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.81 
 
 		 320 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  25 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  23.93 
 
 		 342 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 294 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.05 
 
 		 320 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 329 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 		 325 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>