More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0463 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0463  sugar kinase  100 
 
 		 286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.787563 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1527  sugar kinase  45.61 
 
 		 273 aa  223  4e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1292  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.46 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0263  sugar kinase  43.42 
 
 		 275 aa  217  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0661  hypothetical protein  42.81 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2547  YjeF-related protein  41.09 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0658  sugar kinase  41.05 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0495  hypothetical protein  43.22 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0007  hypothetical protein  40.67 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0007  hypothetical protein  40.67 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.365981  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.7 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  34.3 
 
 		 503 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  34.41 
 
 		 510 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  37.75 
 
 		 488 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  35.51 
 
 		 462 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  35.98 
 
 		 510 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  37.75 
 
 		 486 aa  133  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.53 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  35.98 
 
 		 515 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  33.7 
 
 		 496 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  35.98 
 
 		 515 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  35.98 
 
 		 510 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.98 
 
 		 515 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  35.98 
 
 		 515 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  35.98 
 
 		 515 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  35.98 
 
 		 510 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  35.98 
 
 		 515 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  33.84 
 
 		 504 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.69 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  33.46 
 
 		 504 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  34.43 
 
 		 494 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  33.46 
 
 		 504 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.38 
 
 		 286 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  30.36 
 
 		 499 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  36.68 
 
 		 513 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  33.72 
 
 		 514 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  33.72 
 
 		 514 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.11 
 
 		 496 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  33.72 
 
 		 514 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  36.03 
 
 		 498 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  33.72 
 
 		 514 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  33.72 
 
 		 514 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  32.86 
 
 		 496 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.29 
 
 		 499 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.44 
 
 		 516 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  38.15 
 
 		 493 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  38.15 
 
 		 493 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  35.74 
 
 		 508 aa  119  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  35.66 
 
 		 496 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.06 
 
 		 499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.81 
 
 		 500 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.54 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.81 
 
 		 498 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0525  YjeF-like protein  34.6 
 
 		 590 aa  116  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.069696 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  31.45 
 
 		 511 aa  115  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.95 
 
 		 512 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  31.94 
 
 		 502 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  34.57 
 
 		 436 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 		 510 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  34.73 
 
 		 499 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  31.93 
 
 		 499 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.68 
 
 		 509 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 502 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.47 
 
 		 501 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  34.58 
 
 		 496 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.33 
 
 		 499 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.6 
 
 		 492 aa  109  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.33 
 
 		 499 aa  109  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.45 
 
 		 490 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.9 
 
 		 524 aa  109  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.21 
 
 		 499 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.45 
 
 		 506 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.87 
 
 		 515 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0520  hypothetical protein  33.21 
 
 		 586 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75104  decreased coverage  0.0023767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.49 
 
 		 509 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.43 
 
 		 499 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.68 
 
 		 494 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.82 
 
 		 520 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.22 
 
 		 490 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  29.87 
 
 		 517 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.31 
 
 		 521 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  32.17 
 
 		 499 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  30.25 
 
 		 506 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.3 
 
 		 533 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.95 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.08 
 
 		 529 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.38 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.77 
 
 		 494 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.77 
 
 		 494 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.270642  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  31.62 
 
 		 496 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.73 
 
 		 499 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  29.84 
 
 		 492 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2235  hypothetical protein  27.44 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  36.25 
 
 		 495 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.87 
 
 		 518 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.77 
 
 		 494 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>