More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0437 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
544 aa  1106    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.6 
 
 
546 aa  252  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.73 
 
 
529 aa  239  8e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.17 
 
 
529 aa  206  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  27.99 
 
 
527 aa  205  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  26.55 
 
 
526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1921  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.08 
 
 
522 aa  188  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.684588  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 
588 aa  180  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  26.98 
 
 
572 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.55 
 
 
524 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  28.19 
 
 
541 aa  169  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  26.33 
 
 
546 aa  166  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  26.74 
 
 
577 aa  160  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.39 
 
 
526 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  24.08 
 
 
610 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  26.13 
 
 
563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.57 
 
 
525 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0813  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  26.14 
 
 
528 aa  156  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00386251  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.74 
 
 
533 aa  151  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.21 
 
 
564 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.27 
 
 
574 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.27 
 
 
574 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  26.98 
 
 
573 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.97 
 
 
528 aa  147  6e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.05 
 
 
564 aa  144  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3548  ATPase  24.81 
 
 
601 aa  143  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  24.95 
 
 
575 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0716  ATPase  33.19 
 
 
582 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.68 
 
 
535 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1936  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  23.91 
 
 
585 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  25.89 
 
 
546 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  26.04 
 
 
1138 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  23.24 
 
 
598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  25.56 
 
 
584 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  22.92 
 
 
621 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  24.95 
 
 
554 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.05 
 
 
582 aa  140  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  24.21 
 
 
627 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  32.4 
 
 
550 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.48 
 
 
582 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.48 
 
 
582 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.48 
 
 
582 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.48 
 
 
582 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.48 
 
 
582 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  26.96 
 
 
608 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  23.82 
 
 
592 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.24 
 
 
564 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  25.96 
 
 
572 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.5 
 
 
586 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  37.21 
 
 
593 aa  138  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  26.38 
 
 
714 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  23.6 
 
 
578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  28.42 
 
 
592 aa  138  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.08 
 
 
586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1596  ABC transporter related  25.92 
 
 
600 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0640452  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  23.6 
 
 
578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  23.34 
 
 
577 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1107  ABC transporter, ATP-binding protein  25.97 
 
 
610 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586381  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  22.66 
 
 
581 aa  137  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.66 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  24.66 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.66 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.66 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  24.66 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  24.5 
 
 
596 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.66 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.66 
 
 
582 aa  137  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.66 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.66 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  26.03 
 
 
634 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0508  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.43 
 
 
581 aa  137  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  26.82 
 
 
601 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  27.82 
 
 
600 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  24.81 
 
 
624 aa  137  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  32.31 
 
 
699 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.16 
 
 
618 aa  136  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  25.25 
 
 
566 aa  136  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  24.68 
 
 
598 aa  136  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  23.69 
 
 
597 aa  136  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  25.68 
 
 
589 aa  136  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.78 
 
 
552 aa  136  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  24.84 
 
 
579 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  21.37 
 
 
580 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.51 
 
 
582 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.45 
 
 
613 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3757  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydD  24.55 
 
 
540 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  23.69 
 
 
597 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.81 
 
 
588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  22.66 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  23.76 
 
 
601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  22.45 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.66 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1037  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.23 
 
 
527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000242325  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  24.96 
 
 
597 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.49 
 
 
578 aa  135  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.45 
 
 
586 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1316  lipid/multidrug ABC transporter MsbA ATPase and inner membrane domains  25.14 
 
 
595 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  26.61 
 
 
601 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.66 
 
 
586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.31 
 
 
616 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>