More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0429 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  100 
 
 		 283 aa  586  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  43.02 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  43.19 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  42.19 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  42.11 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  41.42 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  38.65 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  39.92 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  37.4 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  37.12 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  39.37 
 
 		 267 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  37.12 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  38.1 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  38.1 
 
 		 269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  38.1 
 
 		 269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  40.94 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  38.1 
 
 		 269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  38.1 
 
 		 269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  38.1 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  37.7 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  38.1 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  38.1 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  36.84 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  36.61 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  39.13 
 
 		 281 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  35.85 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  37.85 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  38.18 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  41.6 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  35.38 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  36.61 
 
 		 275 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  39.74 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  34.83 
 
 		 272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  35.29 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  35.29 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  35.29 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  36.04 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  37.55 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  37.65 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  36.02 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  36.02 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  39.1 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  38.34 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  38.65 
 
 		 258 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  39.44 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  39.44 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  39.44 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  39.04 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  37.25 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  35.25 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  37.3 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  37.3 
 
 		 275 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  37.3 
 
 		 275 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  35.69 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  34.1 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  39.53 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  36.26 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  38.98 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  37.6 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  36.84 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  35.94 
 
 		 285 aa  169  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  35.36 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  38.04 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  36.36 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  32.81 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  34.66 
 
 		 284 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  36.36 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  35.43 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  34.39 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  36.82 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  35.42 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  34.47 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  34.24 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  33.73 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  35.06 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  36.23 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  34.48 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  33.99 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  35.12 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  36.11 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  31.32 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  34.52 
 
 		 268 aa  158  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  37.67 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  36.33 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  30.77 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  32.28 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  34.47 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  32.3 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  31.48 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  35.94 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  35.86 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  34.13 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  33.59 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  35.94 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  35.29 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  32.41 
 
 		 282 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  31.11 
 
 		 280 aa  152  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  30.89 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0989  glutamate racemase  35.84 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  39.53 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>