More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0427 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  100 
 
 		 103 aa  210  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  64.71 
 
 		 104 aa  144  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  63.73 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  57.28 
 
 		 104 aa  133  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  58.51 
 
 		 104 aa  130  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  55.77 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  54.81 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  56 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  51.46 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  53.06 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  51.02 
 
 		 104 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  51.92 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  46.46 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  46.46 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  46.46 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  54.88 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  47.96 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4349  thioredoxin  47.42 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4648  thioredoxin  47.42 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4417  thioredoxin  47.42 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4256  thioredoxin  47.42 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4268  thioredoxin  47.42 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4649  thioredoxin  47.42 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4758  thioredoxin  47.42 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4633  thioredoxin  47.42 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4629  thioredoxin  47.42 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0273149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0606  thioredoxin  47.42 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  47.96 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3221  thioredoxin  48.45 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  46.53 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  49.04 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  44 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  44.44 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  44.9 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  41 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  44.9 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  45.92 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  49.04 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  51.55 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  47.06 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  44.9 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  45.92 
 
 		 106 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  46.88 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  42.72 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  44.66 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  44.55 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  45.63 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  44.55 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  43.56 
 
 		 109 aa  97.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  43.75 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  46.46 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  43 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  46.08 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  46.46 
 
 		 110 aa  96.7  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  43.56 
 
 		 259 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  48.04 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  43.56 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  58.02 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  43.69 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  47.87 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  43 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  44.55 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  42.72 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  44.44 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  42.31 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  45.36 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  39.6 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  43.69 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  50.51 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  46.08 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  45.45 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  45.1 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  47.78 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  44 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  45.83 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  42 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  41.75 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  44.68 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  41.75 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  45.63 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  42.57 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  44 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  45.1 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  43.3 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>