More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0391 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
431 aa  895    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  66.44 
 
 
431 aa  609  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  65.2 
 
 
431 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  65.28 
 
 
431 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  64.06 
 
 
433 aa  588  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  66.2 
 
 
433 aa  588  1e-167  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  65.27 
 
 
431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  66.13 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  62.67 
 
 
435 aa  578  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  62.67 
 
 
435 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  62.67 
 
 
435 aa  578  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  62.67 
 
 
435 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  62.67 
 
 
435 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  62.44 
 
 
435 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  61.98 
 
 
435 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  62.67 
 
 
435 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  62.67 
 
 
435 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  62.44 
 
 
435 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  63.19 
 
 
432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  63.34 
 
 
432 aa  570  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  59.86 
 
 
431 aa  549  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  59.4 
 
 
431 aa  547  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  59.4 
 
 
431 aa  547  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  58.93 
 
 
430 aa  525  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  56.71 
 
 
431 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  51.97 
 
 
430 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  52.9 
 
 
430 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  52.67 
 
 
431 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  53.24 
 
 
431 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  51.87 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  51.98 
 
 
431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  51.98 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  51.87 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
434 aa  461  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
430 aa  458  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  51.17 
 
 
431 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  51.97 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 
430 aa  457  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  51.75 
 
 
431 aa  455  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 
431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
451 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
451 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  49.53 
 
 
436 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
451 aa  451  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 
431 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
431 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  51.04 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  51.05 
 
 
437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  50.81 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
431 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
436 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 
438 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  47.17 
 
 
443 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  49.42 
 
 
450 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  49.3 
 
 
431 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
435 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  49.31 
 
 
435 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 
435 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  48.13 
 
 
430 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  48.13 
 
 
438 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  49.31 
 
 
433 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 
445 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  49.31 
 
 
435 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  47.9 
 
 
432 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  48.72 
 
 
432 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  49.31 
 
 
435 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0688  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 
435 aa  433  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.930148  normal  0.150396 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 
434 aa  432  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 
433 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  49.31 
 
 
434 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  46.59 
 
 
443 aa  429  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
434 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  48.84 
 
 
434 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  51.16 
 
 
435 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 
435 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
434 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  48.18 
 
 
442 aa  425  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
434 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  48.18 
 
 
442 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  48.18 
 
 
442 aa  423  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
433 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  47.92 
 
 
435 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  48.84 
 
 
431 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  48.96 
 
 
431 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  48.38 
 
 
431 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  48.84 
 
 
431 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  48.38 
 
 
435 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
433 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  46.59 
 
 
442 aa  424  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  46.99 
 
 
431 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  46.82 
 
 
442 aa  421  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  45.96 
 
 
433 aa  420  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
433 aa  421  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  47.92 
 
 
431 aa  418  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  49.18 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  47.1 
 
 
458 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  46.15 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>