More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0390 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 429 aa  879    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  69.23 
 
 		 432 aa  630  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  65.11 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  63 
 
 		 430 aa  595  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  60.89 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  60.89 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  59.95 
 
 		 429 aa  554  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  59.95 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  63.32 
 
 		 430 aa  551  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  60.42 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  59.72 
 
 		 427 aa  551  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  60.51 
 
 		 429 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  60.51 
 
 		 429 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  60.51 
 
 		 429 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  60.51 
 
 		 429 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  60.75 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  60.28 
 
 		 429 aa  522  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  60.28 
 
 		 429 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  60.28 
 
 		 429 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  60.28 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  60.28 
 
 		 429 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  54.59 
 
 		 426 aa  510  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  52.86 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  53.29 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  53.05 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1126  adenylosuccinate synthetase  54.8 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00711413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  53.08 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 427 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 430 aa  458  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  48.37 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  50.47 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  48.12 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  50.84 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 447 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 427 aa  441  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  50.23 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  48.03 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 447 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 		 430 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  46.71 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  47.8 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  48.59 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  48.59 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  48.71 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 		 436 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  47.91 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  49.4 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  48.25 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0976  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000393074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4594  adenylosuccinate synthase  46.59 
 
 		 428 aa  428  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  46.35 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_849  adenylosuccinate synthase  48.22 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000104861  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0867  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000883365  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  47.18 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  46.95 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0767  adenylosuccinate synthetase  48.59 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  49.06 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl074  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  46.35 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  47.32 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0966  Adenylosuccinate synthase  47.55 
 
 		 432 aa  421  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  47.42 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  48.03 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>