More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0361 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 190 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  55.42 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  51.52 
 
 		 171 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  53.61 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  50.31 
 
 		 166 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  50.92 
 
 		 166 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  50.92 
 
 		 166 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  50.6 
 
 		 166 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  53.01 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  45.68 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  46.3 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  46.3 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  46.3 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  46.3 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  46.3 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  46.3 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  46.3 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  46.3 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  46.39 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  45.06 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  47.47 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0010  50S ribosomal protein L10  44.3 
 
 		 166 aa  125  5e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.76481  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  41.07 
 
 		 175 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  41.77 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  35.8 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  34.71 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  38 
 
 		 176 aa  104  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  36.31 
 
 		 172 aa  104  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  36.54 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  35.37 
 
 		 174 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  35.44 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 256 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  36.54 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  36.94 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  36.54 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  33.99 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  36.94 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  33.99 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  35.4 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 175 aa  98.6  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  37.67 
 
 		 215 aa  98.2  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 		 165 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  36.08 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  30.99 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  37.67 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  36.08 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  32.3 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  35.62 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  33.76 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 165 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 165 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 165 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  34.62 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  36.54 
 
 		 179 aa  95.1  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  33.55 
 
 		 172 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  39.72 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  35.43 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  36.91 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  32.9 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  34.01 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  37.74 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  33.56 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  33.56 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  30.25 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 173 aa  91.7  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  33.56 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  39.44 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  30.92 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  36.62 
 
 		 165 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  30.32 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  36.62 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  36.62 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  36.62 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  36.62 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  36.62 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  36.62 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  32.67 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  36.62 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  37.32 
 
 		 167 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  33.56 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  35.8 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>