More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0356 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0356  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000696128 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  82.98 
 
 		 141 aa  237  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  90.78 
 
 		 141 aa  235  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  82.27 
 
 		 141 aa  234  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  80.14 
 
 		 141 aa  225  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  79.29 
 
 		 140 aa  223  7e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  222  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  75.89 
 
 		 141 aa  221  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  78.57 
 
 		 140 aa  221  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  78.57 
 
 		 140 aa  221  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  74.29 
 
 		 141 aa  214  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  73.57 
 
 		 141 aa  212  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  71.94 
 
 		 142 aa  209  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  73.38 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 		 141 aa  202  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  72.26 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  70.5 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 140 aa  200  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  200  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  200  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 140 aa  199  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  75 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  196  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 141 aa  196  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  69.01 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 143 aa  193  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  193  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  192  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 141 aa  190  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  61.7 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 164 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  67.61 
 
 		 143 aa  187  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  65.71 
 
 		 145 aa  187  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  186  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 140 aa  186  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  66.67 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  66.9 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  66.9 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 143 aa  184  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0269  50S ribosomal protein L11  73.57 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000260628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  66.9 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  62.59 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  66.9 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 140 aa  183  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  65 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  64.49 
 
 		 142 aa  183  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>