More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0344 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  100 
 
 		 484 aa  1009    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  52.15 
 
 		 475 aa  523  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  51.18 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  50.75 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  51.07 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  51.07 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  49.58 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  39.1 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  39.91 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  37.58 
 
 		 465 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  36.48 
 
 		 451 aa  292  8e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  37.87 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  35.67 
 
 		 453 aa  289  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  37.08 
 
 		 469 aa  289  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  36.38 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  35.97 
 
 		 471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  36 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  36.63 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  35.7 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  35.71 
 
 		 464 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  36.81 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  35.01 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  36.46 
 
 		 472 aa  277  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  35.56 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  33.76 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  35.52 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  35.85 
 
 		 484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  37.61 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  34.46 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  37.5 
 
 		 478 aa  273  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  33.9 
 
 		 474 aa  273  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  34.53 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  36.06 
 
 		 478 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  35.58 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  36.65 
 
 		 450 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  37.68 
 
 		 478 aa  269  8e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  35.46 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  35.12 
 
 		 463 aa  269  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  35.56 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  35.68 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  36.21 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  33.06 
 
 		 479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 458 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  37.18 
 
 		 474 aa  265  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  35.64 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  34.26 
 
 		 465 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  35.28 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  34.05 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  32.59 
 
 		 462 aa  261  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  35.89 
 
 		 470 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  34.38 
 
 		 467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  33.4 
 
 		 494 aa  259  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  35.56 
 
 		 488 aa  259  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  32.43 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  33.47 
 
 		 473 aa  259  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  33.69 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  32.84 
 
 		 452 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  32.99 
 
 		 462 aa  256  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  35.67 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  35.47 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  34.67 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  34.68 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  33.19 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  33.54 
 
 		 478 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  33.61 
 
 		 488 aa  253  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  33.62 
 
 		 447 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  34.49 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  33.97 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  33.61 
 
 		 909 aa  250  5e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  31.91 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  31.34 
 
 		 499 aa  249  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  33.61 
 
 		 455 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 		 478 aa  249  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  34.54 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  34.2 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  32.54 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  32.35 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  33.54 
 
 		 479 aa  247  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  31.92 
 
 		 460 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  32.35 
 
 		 460 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  31.92 
 
 		 460 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  36.8 
 
 		 461 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  35.24 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  33.9 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  31.54 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  33.33 
 
 		 469 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  31.73 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  31.92 
 
 		 460 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  34.57 
 
 		 467 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  33.69 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  34.29 
 
 		 472 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  32.84 
 
 		 457 aa  243  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  31.92 
 
 		 465 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  35.32 
 
 		 457 aa  243  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  32.55 
 
 		 453 aa  242  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  33.54 
 
 		 500 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  35.62 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  32.48 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>