More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0323 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  73.28 
 
 		 131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  71.88 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  72.66 
 
 		 130 aa  190  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  69.53 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  71.76 
 
 		 131 aa  189  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  68.75 
 
 		 130 aa  186  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  68.75 
 
 		 130 aa  186  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  71.09 
 
 		 130 aa  186  9e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  70.31 
 
 		 130 aa  177  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  68.7 
 
 		 131 aa  175  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  68.7 
 
 		 131 aa  175  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  67.19 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  67.19 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  66.41 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  66.41 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  66.41 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  66.41 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  66.41 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  66.41 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  66.41 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  65.62 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  65.62 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  64.84 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  65.6 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  70.31 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  64 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  61.72 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  61.72 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  63.2 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0629  SSU ribosomal protein S9P  71.2 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  63.36 
 
 		 130 aa  154  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  57.25 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  59.38 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  63.2 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  60.32 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  57.58 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  62.4 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  58.52 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  58.78 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  59.54 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  62.1 
 
 		 170 aa  144  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  57.25 
 
 		 137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 		 128 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  57.25 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 133 aa  143  8.000000000000001e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0349  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 		 136 aa  141  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  61.6 
 
 		 171 aa  141  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1982  30S ribosomal protein S9  58.02 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0810268  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  61.07 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2984  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  54.96 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17391  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  54.48 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17231  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 138 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  54.48 
 
 		 134 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  56.35 
 
 		 134 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  56.49 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  55.73 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  53.44 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23301  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  56.25 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  56 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 169 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 165 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  54.2 
 
 		 264 aa  133  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>