More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0307 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0307  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 174 aa  344  3e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  76.47 
 
 		 169 aa  234  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  63.8 
 
 		 166 aa  218  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  63.8 
 
 		 166 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  63.41 
 
 		 166 aa  215  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  70.27 
 
 		 165 aa  211  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  70.95 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  66.06 
 
 		 168 aa  201  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  58.79 
 
 		 206 aa  200  8e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  61.44 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 166 aa  194  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  68.92 
 
 		 164 aa  191  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  62.09 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  56.44 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1890  30S ribosomal protein S5  68.92 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  187  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  58.06 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 168 aa  184  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  57.43 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  52.76 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  52.76 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 167 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  54.27 
 
 		 166 aa  180  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  58.11 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  58.11 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  57.43 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  54.66 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  56.52 
 
 		 168 aa  178  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  53.05 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 169 aa  177  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  54.61 
 
 		 163 aa  177  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  55.03 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 163 aa  174  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 163 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  54.25 
 
 		 162 aa  174  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  56.55 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  56.08 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  52.17 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  56.08 
 
 		 180 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0679  30S ribosomal protein S5  55.62 
 
 		 254 aa  169  1e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  54.25 
 
 		 162 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  54 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  54.73 
 
 		 197 aa  166  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  52.56 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 		 186 aa  164  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  50.6 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  49.35 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  52.23 
 
 		 172 aa  164  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  52.29 
 
 		 162 aa  164  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  53.79 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  51.01 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  50.89 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  51.35 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  51.28 
 
 		 173 aa  161  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  50.31 
 
 		 200 aa  161  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  51.72 
 
 		 163 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  49.7 
 
 		 189 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  49.7 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  52.08 
 
 		 172 aa  160  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  52.23 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  52.35 
 
 		 187 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  49.66 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  54.61 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  50.66 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  51.25 
 
 		 202 aa  158  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  45.22 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 165 aa  158  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  53.62 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  46.3 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  54.3 
 
 		 186 aa  157  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  47.8 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  51.25 
 
 		 202 aa  157  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  54.41 
 
 		 197 aa  157  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  47.44 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  54.23 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  53.52 
 
 		 238 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>