More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0306 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  75.63 
 
 		 118 aa  184  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  73.11 
 
 		 118 aa  177  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  72.27 
 
 		 118 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  71.43 
 
 		 117 aa  176  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  70.59 
 
 		 118 aa  170  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  68.33 
 
 		 120 aa  168  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 		 119 aa  167  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 		 119 aa  167  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  63.33 
 
 		 120 aa  158  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  63.33 
 
 		 120 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  70.59 
 
 		 115 aa  155  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  62.5 
 
 		 120 aa  154  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  153  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  150  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  60.5 
 
 		 119 aa  150  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  62.5 
 
 		 120 aa  141  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  60.5 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  66.67 
 
 		 117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  67.35 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  59.83 
 
 		 117 aa  136  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  61.61 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  59.65 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  56.91 
 
 		 122 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  56.91 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  59.29 
 
 		 114 aa  130  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  57.38 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  53.28 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  60.58 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  58.04 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1362  ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  61.17 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 123 aa  126  8.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  58.12 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 117 aa  126  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  53.64 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  52.42 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 124 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  57.52 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  61.17 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1558  ribosomal protein L18  57.72 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000783356  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  57.66 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  58.72 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  58.49 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  53.64 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  54.87 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  58.49 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>