More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0294 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 278 aa  564  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  75.18 
 
 		 277 aa  419  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  74.09 
 
 		 277 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  74.55 
 
 		 277 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  75 
 
 		 276 aa  412  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  73.82 
 
 		 281 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 277 aa  394  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 276 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 276 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  69.45 
 
 		 276 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  71.94 
 
 		 279 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  69.82 
 
 		 276 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 		 276 aa  391  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 275 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  63.67 
 
 		 281 aa  363  2e-99  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  64.06 
 
 		 281 aa  362  3e-99  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  64.36 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 		 275 aa  359  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  65.47 
 
 		 277 aa  357  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  65.33 
 
 		 276 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 273 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 276 aa  355  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 277 aa  353  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 275 aa  352  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 275 aa  350  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  62.55 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 277 aa  350  2e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 276 aa  349  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 275 aa  346  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  61.03 
 
 		 280 aa  346  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 275 aa  346  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 275 aa  345  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  61.09 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 275 aa  341  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  59.79 
 
 		 281 aa  341  8e-93  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 276 aa  338  7e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  63.74 
 
 		 274 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 281 aa  333  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  58.55 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 		 274 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 		 274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 274 aa  326  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 274 aa  326  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 287 aa  325  5e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 287 aa  325  5e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  59.21 
 
 		 278 aa  325  6e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 		 277 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0497  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 275 aa  322  3e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000398645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 274 aa  323  3e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 274 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  59.41 
 
 		 287 aa  322  4e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0436  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 275 aa  322  4e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 273 aa  322  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 274 aa  321  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  57.35 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 		 274 aa  319  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 275 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 		 282 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  59.41 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  57.66 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  54.91 
 
 		 287 aa  316  3e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  54.55 
 
 		 287 aa  316  3e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 275 aa  316  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 274 aa  316  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 279 aa  315  4e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  57.3 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  56.46 
 
 		 287 aa  314  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  56.99 
 
 		 276 aa  313  9.999999999999999e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  56.93 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>