More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0291 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  71.9 
 
 		 208 aa  296  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  72.38 
 
 		 208 aa  295  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 		 219 aa  288  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  67.79 
 
 		 211 aa  287  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 210 aa  280  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  66.99 
 
 		 228 aa  279  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 210 aa  277  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 210 aa  277  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 210 aa  277  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 210 aa  277  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 210 aa  277  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 210 aa  277  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 210 aa  277  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 210 aa  277  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  64.76 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  64.76 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  67.66 
 
 		 213 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  62.2 
 
 		 247 aa  265  2.9999999999999995e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  56.48 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  57.87 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  58.05 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  56.94 
 
 		 220 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  56.25 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  57.42 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  53.11 
 
 		 209 aa  231  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  53.11 
 
 		 209 aa  231  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  54.98 
 
 		 211 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  56.59 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  55.29 
 
 		 209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 		 212 aa  217  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 238 aa  207  6e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  49.06 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  50 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  50 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  50.24 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  46.92 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 218 aa  194  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  49.53 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  50 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  51.4 
 
 		 212 aa  191  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 210 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 		 272 aa  189  2e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  46.92 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  46.38 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 211 aa  187  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0226  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00275796  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  45.67 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 211 aa  184  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  45.15 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  49.76 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  46.15 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  49.53 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1574  ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299368  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  49.53 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>